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R语言 genomes包 ncbiRelease()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 19:24:55 | 显示全部楼层 |阅读模式
ncbiRelease(genomes)
ncbiRelease()所属R语言包:genomes

                                         NCBI revision history
                                         NCBI的修订历史

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Returns the date a sequence was first seen at NCBI using the revision history display.
返回序列首次在NCBI使用修订历史记录显示的日期。


用法----------Usage----------


ncbiRelease(ids, db="nuccore", common=TRUE, random=20)



参数----------Arguments----------

参数:ids
A vector or comma-separated list of sequence accessions or GI numbers  
一个序列加入或GI号码的向量或逗号分隔的列表


参数:db
Entrez sequence database to search, default nuccore   
Entrez的序列数据库进行搜索,默认nuccore


参数:common
If replaced sequences are found, search for the earliest date in the common revision history   
如果更换的序列被发现,搜索的最早日期,在共同的修订历史


参数:random
The number of replaced sequences to search  
取代序列搜索


Details

详情----------Details----------

Searches the revision history display and parses the line  listing the date a sequence was first seen at NCBI. In some cases, a sequence replaces earlier IDs and if the common option is TRUE, the earliest date of the replaced sequences is returned instead.  Also, since a sequence accession  may replace 500 or more ids, a random sample of the replaced sequences will be checked.  
搜索修订历史记录显示,解析行列出序列在NCBI的日期。在某些情况下,一个序列取代了较早的ID和common选项是如果返回TRUE,替换序列的最早日期。此外,由于一个序列加入可能取代500个或更多的ID,替换序列的随机抽样检查。


值----------Value----------

A data frame listing the accession, release date, and whether replaced sequences are found
列出加入一个数据框,发行日期,以及是否更换序列被发现


作者(S)----------Author(s)----------


Chris Stubben



举例----------Examples----------



#Yersinia pestis - 1 chromosome and 3 plasmids[鼠疫耶尔森氏菌 -  1号染色体和3质粒]
ncbiRelease("AL590842,AL117189,AL109969,AL117211")
# or skip common revision history[或跳过共同修订历史]
ncbiRelease("AL590842", common=FALSE)
# Protein acc[蛋白质ACC]
ncbiRelease("CAA21395", db="protein")


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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