R语言 genomes包 ncbiGenome()函数中文帮助文档(中英文对照)

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ncbiGenome(genomes)
ncbiGenome()所属R语言包：genomes

                                          NCBI Genome Database  
                                         NCBI的基因组数据库

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Search Entrez Genome at NCBI and retrieve genomes or linked neighbors
搜索Entrez的基因在NCBI和检索基因组或联邻居


用法----------Usage----------


ncbiGenome(term, neighbors=FALSE, derived = TRUE, fulltable = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：term
Any valid combination of Entrez search terms  
Entrez的搜索字词的任何有效组合


参数：neighbors
Search for genome neighbors in Entrez Nucleotide
搜索Entrez的核苷酸基因组的邻居


参数：derived
  If searching neighbors, also include the GenBank assembly that the Reference sequence was derived from   
如果搜索邻居，也包括参考序列来自GenBank中装配


参数：fulltable
Return all summary fields   
返回所有汇总字段


Details

详情----------Details----------

Returns summaries in Entrez Genome or if neighbor is TRUE, then links to Entrez Nucleotide
在Entrez的基因组或如果邻居是TRUE，然后链接到Entrez的核苷酸返回摘要


值----------Value----------

A genomes data frame with 5 columns (acc, name, released date,
一个基因组数据框的5列（ACC，名称，发布日期，


注意----------Note----------

Viral sequences typically have only one reference sequence per species in Entrez genome, and other strains are linked as Genome Neighbors.  
病毒序列通常每个物种只有一个Entrez的基因组参考序列，与其他菌株的基因组邻居联系。


作者（S）----------Author(s)----------


Chris Stubben



参考文献----------References----------



举例----------Examples----------


ncbiGenome('Nipah virus[orgn]')
x<-ncbiGenome('Nipah virus[ORGN]', neighbors = TRUE)
x[1:2,]
summary(x)

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