enaExperiment(genomes)
enaExperiment()所属R语言包:genomes
ENA SRA experiment details
ENA的储备金帐户的实验细节
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Return details about SRA experiments in the ENA
在ENA返回储备金帐户实验的详细信息
用法----------Usage----------
enaExperiment(accs, batchsize = 100)
参数----------Arguments----------
参数:accs
a vector of SRA experiments or a range of accessions with prefix SRX, ERX, DRX, etc.
一个特别储备金帐户的实验向量或与前缀的SRX的ERX,再结晶等一系列的加入
参数:batchsize
number of accs to include in a single comma-separated url string
空运货物清关系统,以包括在一个逗号分隔的URL字符串
Details
详情----------Details----------
Parses some of the tags and values in the XML experiment report
解析一些标签和值在XML的实验报告
值----------Value----------
a data.frame with platform, model and library details like name, layout, source and selection
一个数据框的平台,模型库的详细信息,如姓名,布局,来源和选拔
作者(S)----------Author(s)----------
Chris Stubben
参考文献----------References----------
<h3>See Also</h3>
举例----------Examples----------
# compare to http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/ERX007105[比较到http://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/ERX007105]
enaExperiment("ERX007105")
# chimps[黑猩猩]
pan<-enaSRA(9596)
head(pan)
# first experiment in sample[第一个实验样品]
pan2<-enaExperiment(substr(pan$experiment, 1,9))
head(pan2)
table2(pan2$model)
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