R语言 genomeIntervals包 interval_overlap()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

interval_overlap(genomeIntervals)
interval_overlap()所属R语言包：genomeIntervals

                                        Assess overlap from one set of genomic intervals to another
                                         评估一组基因间隔重叠到另一个

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Given two objects, a 'from' and a 'to', assess which intervals in 'to' overlap which of 'from'.
由于两个对象，一个froma到评估“重叠的”从间隔。


用法----------Usage----------


## S4 method for signature 'Genome_intervals,Genome_intervals'
interval_overlap(
                 from, to,
                 check_valid = TRUE
                 )
## S4 method for signature 'Genome_intervals_stranded,Genome_intervals_stranded'
interval_overlap(
                 from, to,
                 check_valid = TRUE
                 )




参数----------Arguments----------

参数：from
A Genome_intervals or Genome_intervals_stranded object.   
一个Genome_intervals或Genome_intervals_stranded对象。


参数：to
A Genome_intervals or Genome_intervals_stranded object.
一个Genome_intervals或Genome_intervals_stranded对象。


参数：check\_valid
Should validObject be called before passing to compiled code?  
应validObject前传递到编译的代码被称为？


Details

详情----------Details----------

A wrapper calling intervals:interval_overlap by seq_name and by strand (if both to and from are "Genome_intervals_stranded" objects).
一个包装调用intervals:interval_overlapseq_name和strand（如果双方to和from是"Genome_intervals_stranded"对象）。


值----------Value----------

A list, with one element for each row of from. The elements are vectors of indices, indicating which to rows overlap each from. A list element of length 0 indicates a from with no overlapping to intervals.
与每个from行的一个元素的列表。元素是向量的指标，显示to行重叠。列表元素的长度为0表示从没有重叠，间隔。


举例----------Examples----------


data(gen_ints)         
# i as entered[我作为输入]
i

# i in close_intervals notation[我在close_intervals符号]
close_intervals(i)

# j in close_intervals notation[j在close_intervals符号]
close_intervals(j)

# list of intervals of j overlapping intervals of i[j的间隔重叠的，我的时间间隔列表]
interval_overlap(i,j)
         

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。