makeRectangleOverlay(GenomeGraphs)
makeRectangleOverlay()所属R语言包:GenomeGraphs
Create a rectangular overlay
创建一个矩形覆盖
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Construct ractangular overlays.
构建ractangular覆盖。
用法----------Usage----------
makeRectangleOverlay(start, end, region = NULL, coords = c("genomic", "absolute"), dp = NULL)
参数----------Arguments----------
参数:start
Start position in coords coordinates
开始在坐标的坐标位置
参数:end
End position in coords coordinates
在坐标坐标的结束位置
参数:region
Which tracks to span, or the y (vertical range)
追踪跨越,或Y(垂直范围)
参数:coords
Which coordinate system to use, if absolute then the range is from 0,1 and region become the y coordinates
这坐标系统的使用,如果绝对的范围是从0,1和区域成为Y坐标
参数:dp
The display parameters
显示参数
Details
详情----------Details----------
The rectangular overlay can be used to plot overlays in either genomic or absolute coordinates. If coordinates are absolute then the region argument becomes the y arguments.
可用于小区覆盖的矩形覆盖在任何基因或绝对坐标。如果坐标是绝对的,那么该区域的论点成为y参数。
值----------Value----------
An object of class RectangleOverlay
一个类RectangleOverlay对象
举例----------Examples----------
data("exampleData", package = "GenomeGraphs")
cop <- makeGenericArray(intensity = cn, probeStart = probestart,
dp = DisplayPars(size=3, color = "seagreen", type="dot"))
gdPlot(list(makeGenomeAxis(), cop), overlays =
makeRectangleOverlay(start = 180350000, end = 180350000 + 1e5, dp = DisplayPars(alpha = .3)))
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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