makeExonArray(GenomeGraphs)
makeExonArray()所属R语言包:GenomeGraphs
Creates and object of class ExonArray
创建和对象类ExonArray
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Creates an object of class ExonArray, representing exon array microarray data
创建类ExonArray的对象,即外显子阵列芯片数据
用法----------Usage----------
makeExonArray(intensity, probeStart, probeEnd, probeId, nProbes, displayProbesets = FALSE, dp = NULL)
参数----------Arguments----------
参数:intensity
Matrix of intentsities, probes in the rows, samples in the columns
矩阵intentsities,探针行,列中的样本
参数:probeStart
Vector of probe start positions
探针起始位置矢量
参数:probeEnd
Vector of probe end positions (optional)
探针末端位置矢量(可选)
参数:probeId
Character vector containing the probe identifiers
含探针标识的特征向量
参数:nProbes
Vector indicating how many probes are in each probeset
向量表示探针在每个probeset是多少
参数:displayProbesets
Logical indicating if the probeset idenifier should be displayed or not
逻辑表示如果probeset idenifier应显示或不
参数:dp
Object of class DisplayPars to set the display parameters
类DisplayPars对象设置显示参数
值----------Value----------
Object of ExonArray class
ExonArray类对象
作者(S)----------Author(s)----------
Steffen Durinck and Jim Bullard
参考文献----------References----------
<h3>See Also</h3>
举例----------Examples----------
##---- Should be DIRECTLY executable !! ----[#----应直接执行!! ----]
##-- ==> Define data, use random,[ - ==>定义数据,使用随机的,]
##-- or do help(data=index) for the standard data sets.[# - 或做帮助的标准数据集(数据索引)。]
## The function is currently defined as[#函数定义为]
function (intensity, probeStart, probeEnd, probeId, nProbes,
displayProbesets = FALSE, dp = NULL)
{
pt <- getClass("ExonArray")@prototype
if (is.null(dp))
dp <- pt@dp
if (missing(probeEnd))
probeEnd <- pt@probeEnd
if (missing(probeId))
probeId <- pt@probeId
if (missing(nProbes))
nProbes <- pt@nProbes
if (is.null(dp))
dp <- getClass("ExonArray")@prototype@dp
new("ExonArray", intensity = intensity, probeStart = probeStart,
probeEnd = probeEnd, probeId = probeId, nProbes = nProbes,
displayProbesets = displayProbesets, dp = dp)
}
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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