Ideogram-class(GenomeGraphs)
Ideogram-class()所属R语言包:GenomeGraphs
Class "Ideogram", represent an Ideogram
类“表意文字”,代表表意文字
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
An ideogram is a representation of a chromosome containing the banding pattern. Note that currently ideograms are only available for hsapiens.
表意文字是一个包含染色体带型的代表。注意目前表意文字只为hsapiens。
类的对象----------Objects from the Class----------
Objects can be created by calls of the form new("Ideogram", ...).
创建对象可以通过检测的形式new("Ideogram", ...)。
插槽----------Slots----------
chromosome: Object of class "character", representing the chromosome that needs to be drawn. E.g. 3 if chromosome 3 needs to be drawn or Y for Y chromosome.
chromosome:Object类的"character",代表需要绘制的染色体。例如3,如果3号染色体的需求将制定或Y染色体Ÿ。
dp: Object of class "DisplayPars", can be used to specify the size (default 1) of the ideogram in the final plot and to specify the highlighting color
dp:对象类的"DisplayPars",可以用来指定在最后图的表意文字的大小(默认为1),并到指定的高亮颜色
方法----------Methods----------
No methods defined with class "Ideogram" in the signature.
没有定义的方法类“表意文字”签名。
作者(S)----------Author(s)----------
Steffen Durinck
参考文献----------References----------
<h3>See Also</h3> objects to See Also as <code>gdPlot</code>
举例----------Examples----------
if(interactive()){
data("exampleData", package="GenomeGraphs")
minbase <- 180292097
maxbase <- 180492096
ideog <- new("Ideogram", chromosome = "3")
expres <- new("GenericArray", intensity = intensity, probeStart = exonProbePos,
dp = DisplayPars(color="darkred", type="point"))
gdPlot(list(ideog, expres), minBase = minbase, maxBase =maxbase)
}
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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