R语言 GenomeGraphs包 GenericArray-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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GenericArray-class(GenomeGraphs)
GenericArray-class()所属R语言包：GenomeGraphs

                                        Class "GenericArray", representing array data
                                         类“GenericArray”，代表阵列中的数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The Generic Array class is a class that can be used to create plots from array data such as microarrays and arrayCGH platforms. It can represent,  the data as line plots or dot plots and segments can be included as well
通用Array类是一个类，可用于创建数组数据，如芯片和arrayCGH平台图。它可以代表，以及线图或点图和细分的数据可以包含


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("GenericArray", ...).
创建对象可以通过检测的形式new("GenericArray", ...)。


插槽----------Slots----------




intensity: Object of class "matrix", matrix containing the intensities of expression or cgh data.  Rows should be probes, columns samples
intensity：Object类的"matrix"，表达或CGH数据矩阵包含强度。行应该是探针，列样品




probeStart: Object of class "numeric", start position of the probes
probeStart：Object类的"numeric"，启动探针的位置




probeEnd: Object of class "numeric", end position of the probes if available
probeEnd类"numeric"，探针的末端位置的对象（如果可用）


方法----------Methods----------




show signature(object = "GenericArray"): ...
显示signature(object = "GenericArray")：...


作者（S）----------Author(s)----------


Steffen Durinck



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>   objects to See Also as <code>gdPlot</code>

举例----------Examples----------


if(interactive()){
data("exampleData", package="GenomeGraphs")

minbase <- 180292097
maxbase <- 180492096
ideog <- new("Ideogram", chromosome = "3")
expres <- new("GenericArray", intensity = intensity, probeStart = exonProbePos,
              dp = DisplayPars(color="darkred", type="point"))
gdPlot(list(ideog, expres), minBase = minbase, maxBase =maxbase)
}

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注：
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