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R语言 GenomeGraphs包 geneRegionBiomart()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 19:13:59 | 显示全部楼层 |阅读模式
geneRegionBiomart(GenomeGraphs)
geneRegionBiomart()所属R语言包:GenomeGraphs

                                        Construct an AnnotationTrack object from biomaRt.
                                         构建一个从biomaRt AnnotationTrack对象。

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function constructs an AnnotationTrack object from Biomart. It is a convenience function.
这个函数构造一个从Biomart AnnotationTrack对象。这是一个方便的功能。


用法----------Usage----------


geneRegionBiomart(chr, start, end, strand, biomart, dp = NULL, chrFunction = function(x) x, strandFunction = function(x) x)



参数----------Arguments----------

参数:chr
chr An integer
chr整数


参数:start
start The start location  
start开始位置


参数:end
end The end location  
end结束位置


参数:strand
strand An integer -1, 0, 1
strand整数-1,0,1


参数:biomart
biomart A mart
biomart集市


参数:dp
dp DisplayPars object
dp的DisplayPars的对象


参数:chrFunction
chrFunction A function which takes chr and converts it into the correct representation for biomaRt. For instance yeast likes to have chromosomes as roman numerals so you can use as.roman here.
chrFunction以chr它转换成的正确biomaRt表示一个功能。例如酵母喜欢有罗马数字的染色体,所以你可以在这里使用as.roman。


参数:strandFunction
strandFunction Analagous to chrFunction, but for strand. The internal representation of strand is -1,0,1 whereas biomaRt has different species dependent representations.
strandFunctionAnalagous chrFunction,但链。链内部表示-1,0,1,而biomaRt有不同的物种依赖交涉。


值----------Value----------

An AnnotationTrack object.
一个AnnotationTrack对象。


作者(S)----------Author(s)----------


James Bullard

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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