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R语言 GenomeGraphs包 GeneModel-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 19:13:39 | 显示全部楼层 |阅读模式
GeneModel-class(GenomeGraphs)
GeneModel-class()所属R语言包:GenomeGraphs

                                        Class "GeneModel", represents a custom gene model
                                         类“GeneModel”,代表了自定义的基因模型

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This class represents a custom gene model defined by exon boundaries.  An example of this class could be an Affymetrix gene model used to create the Affy Exon array
这个类表示一个自定义的基因外显子边界模型定义。这个类的一个例子是用于创建Affy外显子阵列Affymetrix基因模型


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("GeneModel", ...).
创建对象可以通过检测的形式new("GeneModel", ...)。


插槽----------Slots----------




exonStart: Object of class "numeric", vector containing the start positions of the exons that are to be drawn
exonStart:Object类的"numeric",向量外显子的起始位置,将提请




exonEnd: Object of class "numeric", vector containing the end positions of the exons that are to be drawn
exonEnd:Object类的"numeric",向量外显子的末端位置,将提请




chromosome: Object of class "numeric" , chromosome name
chromosome:对象类"numeric",染色体的名字




dp: Object of class "DisplayPars", color of the exons and size of the exon model in the final plot
dp类"DisplayPars",外显子和外显子模型的大小,颜色对象在最后图


方法----------Methods----------

No methods defined with class "GeneModel" in the signature.
没有任何方法定义类的“GeneModel”签名。


作者(S)----------Author(s)----------


Steffen Durinck



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>  

举例----------Examples----------


data("unrData", package="GenomeGraphs")
affyModel = new("GeneModel", exonStart = unrPositions[,3], exonEnd =  unrPositions[,4])
gdPlot(list(affyModel), minBase = min(unrPositions[,3]), maxBase=max(unrPositions[,4]))



转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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