R语言 GeneSelector包 RankingFoxDimmic()函数中文帮助文档(中英文对照)

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RankingFoxDimmic(GeneSelector)
RankingFoxDimmic()所属R语言包：GeneSelector

                                        Ranking based on the t-statistic of Fox and Dimmic
                                         综合上的福克斯和Dimmic的t-统计

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Performs a two-sample Bayesian t test on a gene expression matrix using
使用上的基因表达矩阵执行两个样本贝叶斯t检验


用法----------Usage----------


RankingFoxDimmic(x, y, type = "unpaired", m = 4, pvalues = TRUE, gene.names = NULL, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
A matrix of gene expression values with rows corresponding to genes and columns corresponding to observations or alternatively an object of class ExpressionSet.
一个matrix基因表达值与相应的基因和相应的意见，或者一个对象类ExpressionSet列行。


参数：y
If x is a matrix, then y may be a numeric vector or a factor with at most two levels.<br> If x is an ExpressionSet, then y is a character specifying the phenotype variable in the output from pData.
x如果是一个矩阵，然后y可能是一个numeric矢量或在大多数两个级别的一个因素。参考如果x是ExpressionSet ，然后y是一个字符指定在pData输出型变量。


参数：type
  


"unpaired":two-sample test, equal variances assumed.     "paired" and "unpaired" are not possible for this kind of test.
“未成”：两样本测试，假定方差相等。 "paired"和"unpaired"是不是这种测试可能。


参数：m
The number of similarly expressed genes to use for calculating Bayesian variance and prior degrees of freedom. The default value suggested by Fox and Dimmic is currently 4, s. note.
同样用于计算贝叶斯方差和自由的前度表达基因的数目。目前由福克斯和Dimmic建议的默认值是4，S。注意。


参数：pvalues
Should p-values be computed ? Default is TRUE.
应的p值计算？默认TRUE。


参数：gene.names
An optional vector of gene names.
一个基因名称可选的向量。


参数：...
Currently unused argument.
目前未使用的参数。


值----------Value----------

An object of class GeneRanking.
对象类GeneRanking。


注意----------Note----------

Although the test of Fox and Dimmic is very similar to that of Baldi and Long; there are various slight differences,
虽然福克斯和Dimmic的测试是非常相似的巴尔迪和术语的，有各种细微的差别，


作者（S）----------Author(s)----------


Martin Slawski  <br>
Anne-Laure Boulesteix



参考文献----------References----------

A two sample Bayesian t-test for microarray data.

参见----------See Also----------

RepeatRanking,  RankingTstat, RankingFC, RankingWelchT, RankingWilcoxon, RankingBaldiLong,  RankingLimma,  RankingEbam, RankingWilcEbam, RankingSam,  RankingShrinkageT, RankingSoftthresholdT,
RepeatRanking，RankingTstat，RankingFC，RankingWelchT，RankingWilcoxon，RankingBaldiLong，RankingLimma，RankingEbam，RankingWilcEbam，RankingSam，RankingShrinkageT，RankingSoftthresholdT


举例----------Examples----------


## Load toy gene expression data[＃加载玩具基因表达数据]
data(toydata)
### class labels[＃＃类的标签]
yy <- toydata[1,]
### gene expression[＃＃基因表达]
xx <- toydata[-1,]
### run RankingFoxDimmic[＃运行RankingFoxDimmic的]
FoxDimmic <- RankingFoxDimmic(xx, yy, type="unpaired")

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