gr.cv(geneRecommender)
gr.cv()所属R语言包：geneRecommender
A function for cross validation
交叉验证功能
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
gr.cv performs leave-one-out cross validation with gr.main for each element of the query.
gr.cv执行留一交叉验证gr.main查询中的每个元素。
用法----------Usage----------
gr.cv(normalized.dataset, query, fun = median)
参数----------Arguments----------
参数：normalized.dataset
A matrix or ExpressionSet containing the normalized gene expression data. The rows correspond to genes, the columns correspond to experiments, and the entries correspond to the gene expression levels. The rows must be labeled. The values contained in normalized.dataset must be either finite or NA.
一个矩阵或ExpressionSet的，规范化的基因表达数据。列对应的行对应的基因，实验，和条目对应的基因表达水平。必须标明的行。 normalized.dataset中所包含的值必须是有限或不适用。
参数：query
A vector containing the query set of genes. These should correspond to the row names of normalized.dataset. The query must contain at least 2 elements
查询基因组包含的一个向量。这些应符合normalized.dataset行名称。查询必须至少包含2个元素
参数：fun
A function used in choosing the number of experiments to include in the calculation. See the help file for gr.main for details.
选择实验的数量，包括在计算中使用函数。 gr.main详情请参阅帮助文件。
Details
详情----------Details----------
In addition to measuring performance, the results of the cross validation can be used to determine if some element(s) in the query might not belong. If one of the elements in the output vector was very large, one would suspect that the associated gene was regulated differently than the other genes in the query.
除了测量的性能，可用于交叉验证的结果，以确定是否在查询中的某些元素（S）可能不属于。如果在输出向量的元素之一，是非常大的，人会怀疑，比在查询中的其他基因，不同的相关基因调控。
值----------Value----------
A vector containing the rank of each element in the query produced by applying gr.main to the query with that element removed.
一个向量，包含在申请gr.main来查询，删除的元素，每个元素的排名产生的查询。
作者（S）----------Author(s)----------
Gregory J. Hather <a href="mailto:ghather@stat.berkeley.edu">ghather@stat.berkeley.edu</a> <br>
with contributions from from Art B. Owen <a href="mailto:art@stat.stanford.edu">art@stat.stanford.edu</a><br>
and Terence P. Speed <a href="mailto:terry@stat.berkeley.edu">terry@stat.berkeley.edu</a>.
参考文献----------References----------
A Gene Recommender Algorithm to Identify Coexpressed Genes in C. elegans. Genome Research 13:1828-1837, 2003.
参见----------See Also----------
gr.main, gr.normalize
gr.main, gr.normalize
举例----------Examples----------
#This example uses the geneData dataset from the Biobase package[这个例子使用BIOBASE包geneData集]
data(geneData)
my.query <- c("31730_at", "31331_at", "31712_at", "31441_at")
normalized.data <- gr.normalize(geneData)
gr.cv(normalized.data, my.query)
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发表于 2012-2-25 18:56:43
