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R语言 genefu包 read.m.file()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 18:50:57 | 显示全部楼层 |阅读模式
read.m.file(genefu)
read.m.file()所属R语言包:genefu

                                         Function to read a 'csv' file containing gene lists (aka gene signatures)
                                         函数读取一个CSV文件,其中包含的基因名单(又名基因签名)

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function allows for reading a 'csv' file containing gene signatures. Each gene signature is composed of at least four columns: "gene.list" is the name of the signature on the first line and empty fields below, "probes" are the probe names, "EntrezGene.ID" are the EntrezGene IDs and "coefficient" are the coefficients of each probe.
此功能允许读“CSV”文件,其中包含的基因签名。每个基因签名至少有四列组成:“gene.list”是签名的第一线,下面的空字段的名称,“探针”探针名称,的“EntrezGene.ID”是EntrezGene ID和“系数”,是每个探针系数。


用法----------Usage----------


read.m.file(file, ...)



参数----------Arguments----------

参数:file
Filename of the 'csv' file.  
“CSV”文件的文件名。


参数:...
Additional parameters for read.csv function.  
read.csv函数的附加参数。


值----------Value----------

List of gene signatures.
基因签名名单。


作者(S)----------Author(s)----------



Benjamin Haibe-Kains




参见----------See Also----------

mod1, mod2, 'extdata/desmedt2008_genemodules.csv', 'extdata/haibekains2009_sig_genius.csv'
mod1,mod2,“extdata/desmedt2008_genemodules.csv,”extdata/haibekains2009_sig_genius.csv“


举例----------Examples----------


## read the seven gene modules as published in Desmedt et al 2008[#读取七个基因在Desmedt等2008公布的模块。]
genemods <- read.m.file(system.file("extdata/desmedt2008_genemodules.csv",
  package = "genefu"))
str(genemods, max.level=1)
## read the three subtype signtaures from GENIUS[#读取从天才的三个亚型signtaures]
geniusm <- read.m.file(system.file("extdata/haibekains2009_sig_genius.csv",
  package = "genefu"))
str(geniusm, max.level=1)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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