R语言 genefu包 gene76()函数中文帮助文档(中英文对照)

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gene76(genefu)
gene76()所属R语言包：genefu

                                         Function to compute the Relapse Score as published by Wang et al. 2005
                                         函数来计算复发得分王等人所发表。 2005年

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function computes signature scores and risk classifications from gene expression values following the algorithm used for the Relapse Score (GENE76) as published by Wang et al. 2005.
此函数计算从基因表达值的签名成绩和风险分类后复发分数（GENE76）王等人发表所使用的算法。 2005年。


用法----------Usage----------


gene76(data, er)



参数----------Arguments----------

参数：data
Matrix of gene expressions with samples in rows and probes in columns, dimnames being properly defined.  
矩阵中的行和列的探针样品的基因表达，dimnames被正确定义。


参数：er
Vector containing the estrogen receptor (ER) status of breast cancer patients in the dataset.  
含有雌激素受体（ER）在DataSet中的乳腺癌患者的状态向量。


值----------Value----------


参数：score
Continuous signature scores
连续签名分数


参数：risk
Binary risk classification, 1 being high risk and 0 being low risk.
二进制风险分类，1是高风险和0是低风险。


作者（S）----------Author(s)----------



Benjamin Haibe-Kains




参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

ggi
ggi


举例----------Examples----------


## load GENE76 signature[＃负载GENE76签名]
data(sig.gene76)
## load VDX dataset[＃加载VDX的数据集]
data(vdxs)
## compute relapse score[＃计算复发评分]
rs.vdxs <- gene76(data=data.vdxs, er=demo.vdxs[ ,"er"])
table(rs.vdxs$risk)

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