R语言 GeneAnswers包 topPATHGenes()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

topPATHGenes(GeneAnswers)
topPATHGenes()所属R语言包：GeneAnswers

                                         Present top KEGG enrichment test information with genes
                                         目前顶级KEGG富集的基因测试信息

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function to present top KEGG enichmentInfo of given GeneAnswers instance with genes.
功能基因顶部KEGG enichmentInfo给予GeneAnswers实例介绍。


用法----------Usage----------


topPATHGenes(x, catTerm = TRUE, keepID=TRUE, geneSymbol = TRUE, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
a given GeneAnswers instance with KEGG test  
一个给定的GeneAnswers实例与KEGG测试


参数：catTerm
logic value to determine whether mapping KEGG IDs to KEGG terms  
逻辑值，以确定是否KEGG的ID映射到KEGG条款


参数：keepID
logic, to determine whether keep KEGG IDs
逻辑，以确定是否保持KEGG标识


参数：geneSymbol
logic value to determine whether mapping gene Entrez IDs to gene symbols
Entrez的标识是否映射基因，以确定基因符号的逻辑值


参数：...
other parameters to transfer to topCategoryGenes  
其他参数转移到topCategoryGenes


Details

详情----------Details----------

See function topCategoryGenes help for details
功能topCategoryGenes帮助详情


值----------Value----------

print necessary information on the screen and save into a specified file if request.
打印在屏幕上的必要信息，并保存到指定的文件，如果请求。


作者（S）----------Author(s)----------


Gang Feng, Pan Du and Simon Lin



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>

举例----------Examples----------


##x is a GeneAnswers instance with KEGG test[＃X是与KEGG测试GeneAnswers的实例]
## Not run: topPATHGenes(x, geneSymbol=TRUE, orderby='genenum', top=6, topGenes=8, genesOrderBy='foldChange') [＃无法运行：topPATHGenes（X，geneSymbol = TRUE的OrderBy =genenum“，顶部= 6，topGenes = 8，genesOrderBy =foldChange）]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。