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R语言 GeneAnswers包 getPATHList()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 18:39:56 | 显示全部楼层 |阅读模式
getPATHList(GeneAnswers)
getPATHList()所属R语言包:GeneAnswers

                                         Retrieve KEGG categories containing given genes
                                         检索包含给定的基因KEGG类别

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function to retrieve KEGG category IDs containing given genes.
函数来检索包含给定的基因KEGG类别ID。


用法----------Usage----------


getPATHList(geneVector, lib)



参数----------Arguments----------

参数:geneVector
an Entrez gene IDs vector  
Entrez基因标识矢量


参数:lib
annotation library to be used to retrieve KEGG IDs.  
注释库,可用于检索KEGG的ID。


Details

详情----------Details----------

The current version only supports Bioconductor team maintained annotation libraries, like 'org.Bt.eg.db', 'org.Ce.eg.db', 'org.Cf.eg.edu', 'org.Dm.eg.db', 'org.Dr.eg.db', 'org.EcK12.eg.db', 'org.EcSakai.eg.db', 'org.Gg.eg.db', 'org.Hs.eg.db', 'org.Mm.eg.db', 'org.Rn.eg.db' and 'org.Ss.eg.db'.
当前版本只支持Bioconductor团队保持注释库,像org.Bt.eg.db“,”org.Ce.eg.db,org.Cf.eg.edu“,”org.Dm.eg.db ,org.Dr.eg.db,org.EcK12.eg.db,org.EcSakai.eg.db,org.Gg.eg.db,org.Hs.eg.db ,org.Mm.eg.db,org.Rn.eg.db和org.Ss.eg.db“。


值----------Value----------

return a KEGG genes ID list, names of the list are KEGG IDs and elements are genes IDs.
返回KEGG基因ID列表,列表的名称是KEGG ID和元素是基因标识。


作者(S)----------Author(s)----------


Gang Feng, Pan Du and Simon Lin



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>

举例----------Examples----------


a <- getPATHList(c('56458', '16590'), 'org.Mm.eg.db')
length(a)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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