R语言 GeneAnswers包 geneAnswersHeatmap()函数中文帮助文档(中英文对照)

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geneAnswersHeatmap(GeneAnswers)
geneAnswersHeatmap()所属R语言包：GeneAnswers

                                         Generate Concept-Gene Tabulates
                                         产生的概念，基因列表

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A function to generate specified Concept-Gene Tabulates
一个函数来生成指定的概念，基因列表


用法----------Usage----------


geneAnswersHeatmap(x, showCats = c(1:5), catTerm = FALSE, geneSymbol = FALSE, catID=FALSE, nameLength='all', showAllGenes=FALSE, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
an instance of GeneAnswers objects  
GeneAnswers对象的一个实例


参数：showCats
a numeric or string vector specified categories   
一个数字或字符串向量指定的类别


参数：catTerm
a logic value to specify whether mapping category IDs to category names  
一个逻辑值，指定是否映射的类别ID类别名称


参数：geneSymbol
a logic value to specify whether mapping gene IDs to gene symbols  
一个逻辑值，指定是否映射基因标识基因符号


参数：catID
a logic value to specify whether show category IDs when catTerm is set to TRUE  
一个逻辑值，指定是否显示类别ID设置为TRUE时catTerm


参数：nameLength
show how many first letters for long term names, 'all' for full name
显示术语的名字多少的第一个字母，“所有”的全名


参数：showAllGenes
logic, show all genes in the heatmap or not  
逻辑，在热图显示所有基因或不


参数：...
other parameters used by geneAnnotationHeatmap  
用于由geneAnnotationHeatmap的其他参数


Details

详情----------Details----------

This function generates concept-gene tabulates for an input GeneAnswers instance. The concept-gene tabulates contain two maps. Left side is a heatmap based on given expression matrix. Right side is a concept-gene map, which could be represented as two-color heatmap or table.
这个函数生成概念基因为输入GeneAnswers实例列表。概念基因列表包含两个图。左侧是在给定的表达矩阵为基础的热图。右侧是一个概念，基因图谱，可作为两色热图或表的代表。


值----------Value----------

The function will generate a map without return value.
该函数将产生一个没有返回值的图。


作者（S）----------Author(s)----------


Gang Feng, Pan Du and Simon Lin



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>

举例----------Examples----------


example(GeneAnswers)
## Not run: geneAnswersHeatmap(x, catTerm=TRUE, geneSymbol=TRUE)[＃运行：geneAnswersHeatmap（X，catTerm = TRUE geneSymbol = TRUE）]

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注：
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