R语言 GeneAnswers包 geneAnswersConceptRelation()函数中文帮助文档(中英文对照)

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geneAnswersConceptRelation(GeneAnswers)
geneAnswersConceptRelation()所属R语言包：GeneAnswers

                                         Display a network related to given concepts for a GeneAnswers instance
                                         显示给定的概念相关的网络为GeneAnswers实例

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A function to display a network related to given concepts of a GeneAnswer instance
一个给定的概念一个GeneAnswer实例显示有关网络的功能


用法----------Usage----------


geneAnswersConceptRelation(x, showCats=c(1:5), conceptsIDs=NULL, directed=TRUE, direction=c('down', 'up', 'both'), catTerm=TRUE, catID=FALSE, nameLength='all', ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
a GeneAnswers instance  
1 GeneAnswers实例


参数：showCats
a numeric or string vector specified categories   
一个数字或字符串向量指定的类别


参数：conceptsIDs
a vector or a data frame or matrix containing possible relative concepts, see details
向量或一个数据框或矩阵含有可能相对的概念，见详情


参数：directed
logic, the network is a directed or not
逻辑，网络是一个定向或不


参数：direction
search direction, it could be 'up', 'down' and 'both'. Valid for directed network only.
搜索方向，它可能是“”，“下”和“都”。仅向网络有效。


参数：catTerm
a logic value to specify whether mapping category IDs to category names  
一个逻辑值，指定是否映射的类别ID类别名称


参数：catID
a logic value to specify whether show category IDs when catTerm is set to TRUE  
一个逻辑值，指定是否显示类别ID设置为TRUE时catTerm


参数：nameLength
show how many first letters for long term names, 'all' for full name  
显示术语的名字多少的第一个字母，“所有”的全名


参数：...
other parameters used by 'getConnectedGraph'  
使用getConnectedGraph“的其他参数


Details

详情----------Details----------

conceptsIDs could be a character vector or a data frame or a matrix. As a character vector, it is a group of concept IDs or names depending on the given GeneAnswers instance,  which are used to be a group of filters to draw a network relative to given concepts specified by showCats. When it is a data frame or matrix, it could be a 2- or 3-column data frame or matrix. The column 2 is always used to be represent nodes color, while the 3rd column is for size of nodes if available.
conceptsIDs可能是一个特征向量或一个数据框或一个矩阵。作为一个特征向量，这是一个组的概念取决于给予GeneAnswers实例，这是一个过滤器组画一个网络相对showCats指定给定的概念上的标识或名称。当它是一个数据框或矩阵，也可能是2  -  3列的数据框或矩阵。 2栏总是要代表节点的颜色，而第三列是如果可用的节点的大小。


值----------Value----------

return a invisible list representing the network.
返回一个无形的名单，代表网络。


作者（S）----------Author(s)----------


Gang Feng, Pan Du and Simon Lin



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>

举例----------Examples----------


require(GeneAnswers)
example(GeneAnswers)
## Not run: geneAnswersConceptRelation(x, UP=FALSE, directed=TRUE, netMode='connection')[＃无法运行：geneAnswersConceptRelation（X，高达= FALSE时，定向= TRUE时，netMode =连接）]

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