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R语言 flowWorkspace包 flowJoWorkspace-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 18:15:52 | 显示全部楼层 |阅读模式
flowJoWorkspace-class(flowWorkspace)
flowJoWorkspace-class()所属R语言包:flowWorkspace

                                        Class "flowJoWorkspace"
                                         类“flowJoWorkspace”

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

An R representation of a flowJo workspace.
ř一个flowJo工作区的代表。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("flowJoWorkspace.xml", ...).
创建对象可以通过检测的形式new("flowJoWorkspace.xml", ...)。


插槽----------Slots----------




version: Object of class "character". The version of the XML workspace.
version类"character"的对象。 XML工作空间的版本。




file: Object of class "character". The file name.
file类"character"的对象。该文件的名称。




.cache: Object of class "environment". An environment for internal use.  
.cache类"environment"的对象。供内部使用的环境。




path: Object of class "character". The path to the file.
path类"character"的对象。该文件的路径。




doc: Object of class "XMLInternalDocument". The XML document object.
doc类"XMLInternalDocument"的对象。 XML文档对象。


方法----------Methods----------




closeWorkspace signature(workspace = "flowJoWorkspace"): Close the workspace file and delete the C representation of the XML document, freeing memory.
closeWorkspacesignature(workspace = "flowJoWorkspace"):关闭工作区文件和删除XML文档的Ç表示,释放内存。




flowWorkspace2flowCore signature(obj = "flowJoWorkspace"): Convert a flowJo workspace to a flowCore workflow
flowWorkspace2flowCoresignature(obj = "flowJoWorkspace"):转换flowJo工作区到flowCore工作流程




getCompensationMatrices signature(x = "flowJoWorkspace"): Retrieve the compensation matrices in the flowJo workspace.
getCompensationMatricessignature(x = "flowJoWorkspace"):找回在flowJo工作区补偿矩阵。




getKeywords signature(obj = "flowJoWorkspace", y = "character"): Get the keywords for sample y from the flowJo workspace
getKeywordssignature(obj = "flowJoWorkspace", y = "character"):获取样品Ÿ关键字从flowJo工作区,




getSampleGroups signature(x = "flowJoWorkspace"): Get the sample groups defined in the flowJo workspace.
getSampleGroupssignature(x = "flowJoWorkspace"):获取样品在flowJo工作区中定义的组。




getSamples signature(x = "flowJoWorkspace"): Get the samples listed in the flowJo workspace.
getSamplessignature(x = "flowJoWorkspace"):在flowJo工作区中列出的样本。




getTransformations signature(x = "flowJoWorkspace"): Get the data transformations listed in the flowJo workspace
getTransformationssignature(x = "flowJoWorkspace"):获取上市在flowJo工作区的数据转换




parseWorkspace signature(obj = "flowJoWorkspace"): Parse a workspace, creating a GatingSet.
parseWorkspacesignature(obj = "flowJoWorkspace"):解析一个工作区,创建一个GatingSet。




show signature(object = "flowJoWorkspace"): Print information about a workspace
显示signature(object = "flowJoWorkspace"):有关工作区的打印信息




summary signature(object = "flowJoWorkspace"): Summarize
摘要signature(object = "flowJoWorkspace"):总结


作者(S)----------Author(s)----------



Greg Finak <gfinak@fhcrc.org>




参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

GatingSet  GatingHierarchy
GatingSetGatingHierarchy


举例----------Examples----------


require(flowWorkspaceData)
d<-system.file("extdata",package="flowWorkspaceData")
wsfile<-list.files(d,pattern="A2004Analysis.xml",full=TRUE)
ws <- openWorkspace(wsfile);
summary(ws)
getSamples(ws)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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