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R语言 flowQ包 qaProcess.timeline()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 18:07:43 | 显示全部楼层 |阅读模式
qaProcess.timeline(flowQ)
qaProcess.timeline()所属R语言包:flowQ

                                          Create QA process of type 'timeline'
                                         QA流程创建类型为“时间表”

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes a flowSet as input and  creates all necessary output for a 'timeline' type QA process. Objects created by this function can be laid out as HTML using writeQAReport.
这个函数需要作为输入flowSet,并创建一个“时间表”型QA流程的所有必要的输出。由这个函数创建的对象可以作为HTML使用writeQAReport奠定了。


用法----------Usage----------



qaProcess.timeline(set, channels=NULL, outdir, cutoff=1,
  name="time line", sum.dimensions=NULL, det.dimensions=c(3,2),
  pdf=TRUE, ...)




参数----------Arguments----------

参数:set
A flowSet  
一个flowSet


参数:channels
A character vector of channel names for which the qaReport is to be produced. Will use all available channels except for the time channel if NULL.
其中的qaReport是要产生一个频道名称的字符向量。除外,如果NULL时间通道将使用所有可用的频道。


参数:outdir
The directory to which the graphical output is to be saved. If multiple QA processes are to be combined, make sure to use the same directory for all of them.
图形输出要保存的目录。如果要合并的多个QA流程,确保所有使用同一目录。


参数:cutoff
The threshold at which the QA criterion is considered to be failed. An absolute value in the timeline deviation score as computed by the timeLinePlot function.  
阈值的质量保证标准被认为是失败。在时间轴上的偏差得分的绝对值,timeLinePlot函数的计算。


参数:name
The name of the process used for the headings in the HTML output.
该进程的名称用于在HTML输出的标题。


参数:sum.dimensions, det.dimensions
The dimensions of the pdf device in inches used for the summary and the detailed plots.
英寸尺寸的PDF设备用于总结和详细图。


参数:pdf
Logical indicating whether to create vectorized versions of images for this quality process. This should be set to FALSE if disk space is critical, since the pdf versions of the image consume much more space on the hard drive compared to the bitmap version.
逻辑说明是否要建立这种质量的过程量化的图像版本。这应设置为FALSE如果磁盘空间是至关重要的,因为图像的PDF版本点阵图版本相比硬盘驱动器上消耗更多的空间。


参数:...
Further arguments.
进一步的论据。


Details

详情----------Details----------

QA processes of type 'timeline' detect unusal patterns in the acquisition of fluorescense and light scatter measurements over time. These are detected dynamically by identifying trends in the signal intensity over time or local changes in the measurement intensities. The underlying hypothesis is that measurement values are acquired randomly, hence there shouldn't be any correlation to time.
QA流程检测类型“时间轴”不同寻常的模式,在收购随着时间的推移,荧光强度和光散射测量。这些动态检测识别信号强度随着时间的推移或在测量强度的局部变化的趋势。基本的假设是随机获得测量值,因此,不应该有任何时间相关性。

For more details on how to layout qaProcess objects to  HTML, see writeQAReport and qaReport.
对于如何布局qaProcess对象为HTML的更多细节,请参阅writeQAReport和qaReport。


值----------Value----------

An object of class qaProcess.
对象类qaProcess。


作者(S)----------Author(s)----------


Florian Hahne



参见----------See Also----------

writeQAReport, qaReport, qaProcess, qaProcess.marginevents qaProcess.timeflow, qaProcess.cellnumber
writeQAReport,qaReport,qaProcess,qaProcess.margineventsqaProcess.timeflow,qaProcess.cellnumber


举例----------Examples----------


## Not run: [#无法运行:]
data(GvHD)
GvHD <- transform(GvHD, "FL1-H"=asinh(`FL1-H`), "FL2-H"=asinh(`FL2-H`))
dest <- tempdir()
qp <- qaProcess.timeline(GvHD, channel="FL1-H", outdir=dest, cutoff=1)
qp

## End(Not run)[#结束(不运行)]


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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