R语言 flowQ包 qaProcess.BoundaryPlot()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

qaProcess.BoundaryPlot(flowQ)
qaProcess.BoundaryPlot()所属R语言包：flowQ

                                          Creates a QA process for comparison of the percentage of boundary
                                         创建一个QA过程比较边界的百分比

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes a list of flowSet as input and  creates all necessary output for a 'BoundaryPlot' type QA process. Objects created by this function can be laid out as HTML using writeQAReport.
此功能需要的flowSet列表作为输入，并创建所有必要的输出“BoundaryPlot类型的QA流程。由这个函数创建的对象可以作为HTML使用writeQAReport奠定了。


用法----------Usage----------



qaProcess.BoundaryPlot(flowList,dyes=NULL,
                          outdir="QAReport",cutoff=3,sum.dimensions=NULL,
                          det.dimensions=NULL,pdf=TRUE,name="Boundary",
                          side="both",...)



参数----------Arguments----------

参数：flowList
A list of flowSet  
一个的flowSet列表


参数：dyes
Flow parameters to be compared across multiple samples.  If set to NULL, all parameters that are duplicated across the list of  flowSet are identified and compared.
流参数进行比较多个样本。如果设置为NULL，整个列表重复的所有参数flowSet确定和比较。


参数：outdir
The directory to which the graphical output is to be saved. If multiple QA processes are to be combined, make sure to use the same directory every time.  
图形输出要保存的目录。如果要合并的多个QA流程，确保每次使用相同的目录。


参数：cutoff
A numeric value for the percentage of boundary events that is  used by the  process to identify samples that failed the QA process
一种是由使用过程中失败的QA流程，以确定样本的边界事件的百分比数值


参数：sum.dimensions
The dimensions of summary plot generated in inches, default is NULL where the dimensions are automatically selected
总结图产生英寸的尺寸，默认值为NULL的尺寸自动选择


参数：det.dimensions
the dimensions of each sub image generated by the QA process in inches, default is NULL where the dimensions are automatically selected.  
英寸的QA过程中产生的每个子图像的尺寸，默认值为NULL的尺寸自动选择。


参数：pdf
boolen value determinining if pdf files or jpeg images will be produced by the QA process   
boolen价值determinining如果PDF文件或JPEG图像将由QA流程


参数：name
The name of the process used for the headings in the HTML output.  
该进程的名称用于在HTML输出的标题。


参数：side
Object of class "character". The margin on which to evaluate the filter. Either upper for the upper margin or lower for the lower margin or both for both margins.  
对象类"character"。评估过滤器的保证金。要么upper上缘或lower较低的保证金或both都利润率。


参数：...
Further arguments.
进一步的论据。


Details

详情----------Details----------

QA processes of type 'BoundaryPlot'  helps identify samples that have a large  number of boundary events that must be removed by further gating before  detailed analysis of the data.
QA流程类型BoundaryPlot“有助于查明有大量边界事件必须通过进一步的门之前删除的数据的详细分析的样品。

For more details on how to layout qaProcess objects to  HTML, see writeQAReport and qaReport.
对于如何布局qaProcess对象为HTML的更多细节，请参阅writeQAReport和qaReport。


值----------Value----------

An object of class qaProcess.
对象类qaProcess。


作者（S）----------Author(s)----------


Nishant Gopalakrishnan



参见----------See Also----------

writeQAReport, qaReport, qaProcess, qaProcess.DensityPlot, qaProcess.ECDFPlot
writeQAReport，qaReport，qaProcess，qaProcess.DensityPlot，qaProcess.ECDFPlot


举例----------Examples----------


data(qData)
dest <- tempdir()
resBoundary <- qaProcess.BoundaryPlot(qData, dyes=c("FSC-A","CD3"),
                                      outdir=dest, cutoff=3, pdf=TRUE)
resBoundary


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。