R语言 flowPlots包 computePFDPartsData-methods()函数中文帮助文档(中英文对照)

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computePFDPartsData-methods(flowPlots)
computePFDPartsData-methods()所属R语言包：flowPlots

                                        Method computePFDPartsData from Class "StackedData"
                                         方法computePFDPartsData班“StackedData”

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function is a method of the StackedData class which computes the pfdParts data  which can be stored in the pfdPartsData slot of a StackedData object.  This method relies on the marker data slot being assigned in the StackedData object.  
此功能的方法计算，可以存储在一个StackedData对象pfdPartsData插槽pfdParts数据的StackedData类。这种方法依赖于标记数据被在StackedData对象分配的插槽。


用法----------Usage----------


   computePFDPartsData(object, byVarNames, idVarName, percentVarName, groupVarName)   



参数----------Arguments----------

参数：object
an object of the StackedData class
的StackedData类的对象


参数：byVarNames
character; the names of the variables specifying the subsets of interest in the data
字符;指定感兴趣的数据子集的变量的名称


参数：idVarName
character; the name of the id variable in the data
性格中的数据的id变量的名称


参数：percentVarName
character; the name of the variable holding the percentages to be summed when computing the pfd summary data
字符;持有的百分比计算的PFD汇总数据时，要总结的变量的名称


参数：groupVarName
character; the name of the variable specifying the group assignment in the data
字符;变量名中指定的数据组分配


值----------Value----------

a list. Each element of the list is a data frame containing the component percents for a given degree of polyfunctionality (PFD), except for the max PFD since there is only  one possible combination for the max PFD.  
一个列表。列表中的每个元素是一个数据框包含了polyfunctionality（PFD）的程度组件％，最大的PFD，因为只有一个可能的组合的最大PFD的除外。


方法----------Methods----------




signature(object = "StackedData", byVarNames = "character", idVarName = "character", percentVarName = "character", groupVarName = "character") Compute the pfd parts data.
signature(object = "StackedData", byVarNames = "character", idVarName = "character", percentVarName = "character", groupVarName = "character")计算PFD部分数据。


作者（S）----------Author(s)----------


N. Hawkins, Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle, WA



参见----------See Also----------

StackedData, pfdPartsData
StackedData，pfdPartsData


举例----------Examples----------


# Load stacked data[载入堆叠数据]
data(adultsNeonates)
# Create a stacked data object[创建一个堆叠的数据对象]
stackedDataObject = new("StackedData", stackedData=adultsNeonates)

# Compute the marker data and set the marker data slot[计算标记的数据和设置标记的数据槽]
markerNames = c("TNFa","IL6","IL12","IFNa")
markers = computeMarkers(markerNames,includeAllNegativeRow=TRUE)
markers(stackedDataObject) = markers

# Compute the pfd parts data and set the pfd parts data slot[PFD部分计算数据和设置PFD部分数据槽]
byVarNames = c("stim", "concGroup", "cell")
pfdPartsData = computePFDPartsData(stackedDataObject, byVarNames, "id", "percentAll", "group")
pfdPartsData(stackedDataObject) = pfdPartsData


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