R语言 flowPhyto包 summarize()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

summarize(flowPhyto)
summarize()所属R语言包：flowPhyto

                                        Summarize phytoplankon event & log parameters
                                         总结phytoplankon事件log参数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

perform aggregate statistics on a particular combination of events (in a dataframe) per population.
执行人口特别是结合每一个事件（一个dataframe）汇总统计。


用法----------Usage----------


summarize(x, channel.clmns = CHANNEL.CLMNS, opp.paths.str='1,2,3')




参数----------Arguments----------

参数：x
event dataframe
事件dataframe


参数：channel.clmns
flow cyometry event-level chanels columns in the dataframe (x) on which to perform aggreate statistics (mean and standard deviation).
流cyometry事件级别chanels，在dataframe列（X）执行aggreate的统计（平均数和标准差）。


参数：opp.paths.str
a comma delimited string of file names
逗号分隔的字符串的文件名


值----------Value----------

returns an aggregate statistics dataframe
返回总额统计dataframe的


举例----------Examples----------



opp.paths <- sapply(c(1,2,3), function(i)
      system.file("extdata","seaflow_cruise","2011_001", paste(i,'.evt.opp',sep=''),
          package="flowPhyto"))

filter.df <- do.call(rbind.data.frame, lapply(opp.paths, readSeaflow,
                                                add.yearday.file=TRUE))
consen.df <- do.call(rbind.data.frame, lapply(opp.paths, readConsensusFile))
classed <- cbind.data.frame(filter.df, consen.df)


nrow.opp <- sapply(opp.paths, function(p) readSeaflow(              p , count.only=TRUE))
nrow.evt <- sapply(opp.paths, function(p) readSeaflow(sub('.opp','',p), count.only=TRUE))
classed$opp <- rep(nrow.opp, times=nrow.opp)
classed$evt <- rep(nrow.evt, times=nrow.opp)
  
summary(classed)

class.jn <- do.call(rbind.data.frame, by(classed, list(classed$file),
                        joinSDS, caroline::nv(opp.paths, sapply(opp.paths, getFileNumber)) ))
summarize(class.jn,  opp.paths.str=paste(names(opp.paths), collapse=','))


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。