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R语言 flowPhyto包 plotCytogram()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 18:01:09 | 显示全部楼层 |阅读模式
plotCytogram(flowPhyto)
plotCytogram()所属R语言包:flowPhyto

                                        Plot a Phytoplankton Cytogram
                                         绘制浮游植物Cytogram

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plot a Phytoplankton Cytogram
绘制浮游植物Cytogram


用法----------Usage----------


plotCytogram(df, x.ax, y.ax, add.legend=FALSE, pop.def=POP.DEF, cex=0.5, pch=1, xlab = x.ax, ylab = y.ax, ...)



参数----------Arguments----------

参数:df
a dataframe of events (rows) and channels (columns).
dataframe的事件(行)和渠道(列)。


参数:x.ax
column to plot in the x.axis
列绘制在x.axis


参数:y.ax
column to plot in the y.axis
列绘制在y.axis


参数:add.legend
should the plot automatically generate a legend
图应该自动生成图例


参数:pop.def
A population (rows) definition dataframe with parameters (columns) for gating and clustersing.
一个人口(行)定义dataframe为门和clustersing参数(列)。


参数:cex
character expansion for the points.  Undefined background points are 1/3rd of the foreground points.
字符扩展点。 1/3rd的前景不确定的背景点。


参数:pch
point character
点字符


参数:xlab
label for the x axis. by default equals x.ax
为x轴的标签。默认情况下,等于x.ax


参数:ylab
label for the y axis. by default equals y.ax
为y轴的标签。默认情况下,等于y.ax


参数:...
other paramters passed to plot
通过绘制的其他参数研究


值----------Value----------

a cytogram plot
1 cytogram图


举例----------Examples----------


opp.file.path <- system.file("extdata","seaflow_cruise","2011_001", "1.evt.opp",
                        package="flowPhyto")
pop.file.path <- system.file("extdata","seaflow_cruise","pop.def.tab",
                        package="flowPhyto")

opp <- readSeaflow(opp.file.path)
def <- readPopDef(pop.file.path)
pop <- classify(x=opp, pop.def= def)

# Visualize the result of Classify using the function plotCytogram()[可视化的分类使用功能plotCytogram(结果)]
plotCytogram(pop, "fsc_small","chl_small", pop.def= def)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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