fitPiecewiseLinreg(flowMerge)
fitPiecewiseLinreg()所属R语言包:flowMerge
Fit Piecewise Linear Regression for a list of flowMerge Objects
适合分段线性回归flowMerge对象名单
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Fits a two–component piecewise linear regression to the entropy vs number of clusters for a list of merged cluster solutions.
适合两个组成部分的分段线性回归的熵与数字聚类合并聚类解决方案的列表。
用法----------Usage----------
fitPiecewiseLinreg(x, plot=FALSE, normalized=TRUE, ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
A "list" of flowMerge objects for 1 through K clusters derived from a single max BIC flowObj or flowClust object.
flowMerge对象“名单”1K从一个单一的最大的BICflowObj或flowClust对象派生聚类。
参数:plot
A logical indicating whether to plot the fit or not. Default is FALSE.
一个logical指示是否绘制或不适合。默认为false。
参数:normalized
A logical indicating whether the merging should be done using the normalized or unnormalized entropy
一个logical说明合并是否应该使用的规范化或者非标准化的熵
参数:...
Additional arguments not currently used.
目前没有使用额外的参数。
Details
详情----------Details----------
An S4 method that takes a list of flowMerge objects output by the merge method, extracts the entropy and fits a piecwise linear regression to the entropy vs number of clusters in order to find the postion of the changepoint. The location of the changepoint corresponds to the optimal merged cluster solution. The piecewise linear regression now is fitted to the entropy vs cumulative sum of merged observations at each number of clusters. This normalizes the change in entropy for the number of data points as described in Baudry et al.
一个的S4方法,flowMerge方法merge对象输出的列表,提取熵和适合线性piecwise回归的熵与数字聚类,为了找到现在的位置,变点。变点的位置对应的最优合并聚类解决方案。分段线性回归现在是装在每个聚类熵合并的意见与累计总和。这标准化博德里等数据点的数量熵的变化。
值----------Value----------
An integer value corresponding to the position of the changepoint.
integer值相应变点的位置。
作者(S)----------Author(s)----------
Greg Finak <a href="mailto:<greg.finak@ircm.qc.ca>"><greg.finak@ircm.qc.ca></a>
参考文献----------References----------
<h3>See Also</h3>
举例----------Examples----------
#data(rituximab)[数据(美罗华)]
#data(RituximabFlowClustFit)[数据(RituximabFlowClustFit)]
#o<-flowObj(flowClust.res[[which.max(BIC(flowClust.res))]],rituximab);[O <flowObj(flowClust.res [which.max(BIC(flowClust.res))],美罗华);]
#m<-merge(o)[合并M <(O)]
#i<-fitPiecewiseLinreg(m);[我<fitPiecewiseLinreg(M);]
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