splitscale-class(flowCore)
splitscale-class()所属R语言包:flowCore
Class "splitscale"
类“splitscale”
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The split scale transformation class defines a transformation that has a logarithmic scale at high values and a linear scale at low values. The transition points are chosen so that the slope of the transformation is continuous at the transition points.
分裂大规模改造类定义了一个转型,有一个高值和低值的线性度的对数刻度。因此,改造坡是连续过渡点,过渡点的选择。
The split scale transformation is defined by the function
分割尺度变换函数的定义
where,
在那里,
类的对象----------Objects from the Class----------
Objects can be created by calls to the constructor splitscale(parameters,r,maxValue,transitionChannel,transformationId)
创建对象可以通过调用构造splitscale(parameters,r,maxValue,transitionChannel,transformationId)
插槽----------Slots----------
.Data: Object of class "function" ~~
.Data:Object类的"function"~~
r: Object of class "numeric"-a positive value indicating the range of the logarithmic
r类"numeric"-一个积极的价值表示的数的范围对象
maxValue: Object of class "numeric" -a positive value indicating the maximum value the transformation
maxValue:对象类"numeric"-一个积极的表示最大值改造的价值
transitionChannel: Object of class "numeric" -non negative value that indicates where to
transitionChannel类"numeric"非负值表示:对象
parameters: Object of class "transformation" - flow parameter to be transformed
parameters:类"transformation"流参数的对象 - 转化
transformationId: Object of class "character"-unique ID to reference the transformation
transformationId类"character"唯一的ID对象引用的改造
延伸----------Extends----------
Class "singleParameterTransform", directly. Class "transform", by class "singleParameterTransform", distance 2. Class "transformation", by class "singleParameterTransform", distance 3. Class "characterOrTransformation", by class "singleParameterTransform", distance 4.
类"singleParameterTransform",直接。类"transform",类“singleParameterTransform”,距离为2。类"transformation",类“singleParameterTransform”,距离3。类"characterOrTransformation",类“singleParameterTransform”,距离4。
方法----------Methods----------
No methods defined with class "splitscale" in the signature.
没有定义的方法与类的“splitscale”签名。
注意----------Note----------
The transformation object can be evaluated using the eval method by passing the data frame as an argument.The transformed
改造的对象,可以使用eval方法的评估,通过作为转变argument.The的数据框
作者(S)----------Author(s)----------
Gopalakrishnan N, F.Hahne
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
invsplitscale
invsplitscale
举例----------Examples----------
dat <- read.FCS(system.file("extdata","0877408774.B08",package="flowCore"))
sp1<-splitscale("FSC-H",r=768,maxValue=10000,transitionChannel=256)
transOut<-eval(sp1)(exprs(dat))
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