R语言 eisa包 ISAFilterRobust()函数中文帮助文档(中英文对照)

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ISAFilterRobust(eisa)
ISAFilterRobust()所属R语言包：eisa

                                        Robustness of ISA biclusters
                                         鲁棒性的ISA biclusters

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Robustness of ISA biclusters. The more robust biclusters are more significant, in the sense that they are less likely to be
鲁棒性的ISA biclusters。更强大的biclusters更为显着，在这个意义上，他们是不太可能


用法----------Usage----------


ISARobustness(data, isaresult)
ISAFilterRobust(data, isaresult, ...)



参数----------Arguments----------

参数：data
An ExpressionSet or ISAExpressionSet object. If an ExpressionSet object is supplied, then it is normalised by calling ISANormalize on it.
ExpressionSet或ISAExpressionSet对象。如果ExpressionSet对象提供的，那么它被调用ISANormalize标准化。


参数：isaresult
An ISAModules object, a set of modules.
ISAModules对象，一组模块。


参数：...
Additional arguments, they are passed to the isa.filter.robust function in the isa2 package.
额外的参数，它们传递给isa.filter.robustisa2包的功能。


Details

详情----------Details----------

ISARobustness calculates robustness scores for ISA modules. The higher the score, the more robust the module.
ISARobustness计算鲁棒性分数为ISA模块。分数越高，更强大的模块。

ISAFilterRobust filters a set of ISA modules, by running ISA on the randomized expression data and then eliminating all modules that have a robustness score that is lower than at least one robustness score found in the randomized data.
ISAFilterRobust过滤一套的ISA模块，运行ISA上的随机表达数据，然后消除所有模块具有鲁棒性的得分是超过至少一个鲁棒性随机数据中发现的得分低。

The same feature and sample thresholds are used to calculate the randomized robustness scores. In other words the limit for the filtering depends on the feature and sample thresholds.
相同的功能和样品的阈值是用来计算的随机鲁棒性分数。换句话说，过滤的限制取决于功能和样品阈值。

You can find more details in the manual of the robustness function in the isa2 package.
你可以找到在robustnessisa2包的功能手册的更多细节。


值----------Value----------

ISARobustness returns a numeric vector, the robustness scores of the biclusters.
ISARobustness返回一个数值向量，鲁棒性的biclusters的分数。

ISAFilterRobust returns the filtered ISAModules instance.
ISAFilterRobust返回过滤ISAModules实例。


作者（S）----------Author(s)----------



Gabor Csardi <a href="mailto:Gabor.Csardi@unil.ch">Gabor.Csardi@unil.ch</a>




参考文献----------References----------

analysis of large-scale gene expression data Phys Rev E Stat Nonlin Soft Matter Phys. 2003 Mar;67(3 Pt 1):031902. Epub 2003 Mar 11.

参见----------See Also----------

The robustness function in the isa2 package.
robustnessisa2包功能。


举例----------Examples----------


data(ALLModules)
library(ALL)
data(ALL)
rob <- ISARobustness(ALL, ALLModules)
summary(rob)

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