R语言 edgeR包 subsetting()函数中文帮助文档(中英文对照)

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subsetting(edgeR)
subsetting()所属R语言包：edgeR

                                        Subset DGEList, DGEGLM, DGEExact and DGELRT Objects
                                         子集DGEList，DGEGLM，DGEExact和DGELRT的对象

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Extract a subset of a DGEList, DGEGLM, DGEExact or DGELRT object.
提取DGEList，DGEGLM，DGEExact或DGELRT对象的子集。


用法----------Usage----------


## S3 method for class 'DGEList'
object[i, j, ...]
## S3 method for class 'DGEGLM'
object[i, j, ...]
## S3 method for class 'DGEExact'
object[i, j, ...]
## S3 method for class 'DGELRT'
object[i, j, ...]



参数----------Arguments----------

参数：object
object of class DGEList, DGEGLM, DGEExact or DGELRT, respectively
对象类DGEList，DGEGLM，DGEExact或DGELRT，分别


参数：i,j
elements to extract. i subsets the tags or genes while j subsets the libraries. Note, columns of DGEGLM, DGEExact and DGELRT objects cannot be subsetted.
提取的元素。 i亚群的标记或基因，而j子集库。请注意，列DGEGLM，DGEExact和DGELRT对象不能将子集。


参数：...
not used
不使用


Details

详情----------Details----------

i,j may take any values acceptable for the matrix components of object of class DGEList. See the Extract help entry for more details on subsetting matrices. For DGEGLM, DGEExact and DGELRT objects, only rows (i.e. i) may be subsetted.
i,j可能采取的任何值接受object类DGEList基质成分。看到更多细节上的子集矩阵的提取物，帮助条目。 DGEGLM，DGEExact和DGELRT对象的行（即i）可能子集。


值----------Value----------

An object of class DGEList, DGEGLM, DGEExact or DGELRT as appropriate, holding data from the specified subset of tags/genes and libraries.
一个类的对象DGEList，DGEGLM，DGEExact或DGELRT适当，从指定标签/基因和库子集的数据。


作者（S）----------Author(s)----------


Davis McCarthy, Gordon Smyth



参见----------See Also----------

Extract in the base package.
Extract基本包。


举例----------Examples----------


d <- matrix(rnbinom(16,size=1,mu=10),4,4)
rownames(d) <- c("a","b","c","d")
colnames(d) <- c("A1","A2","B1","B2")
d <- DGEList(counts=d,group=factor(c("A","A","B","B")))
d[1:2,]
d[1:2,2]
d[,2]
d <- estimateCommonDisp(d)
results <- exactTest(d)
results[1:2,]
# NB: cannot subset columns for DGEExact objects[注意：不能为DGEExact对象的子集列]

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