R语言 edgeR包 getCounts()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

getCounts(edgeR)
getCounts()所属R语言包：edgeR

                                        Extract Table of Counts from DGEList Object
                                         提取Object从DGEList的计数表

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Returns the counts component of a DGEList object
返回一个DGEList对象counts组件


用法----------Usage----------


getCounts(object)



参数----------Arguments----------

参数：object
DGEList object containing (at least) the elements counts (table of raw counts), group (factor indicating group) and lib.size (numeric vector of library sizes)
DGEList对象，其中包含（至少）的元素counts（原始计数表），group（因子组）和lib.size（数字图书馆大小的向量）


值----------Value----------

getCounts returns a matrix of counts (presumably integers)
getCounts返回的计数矩阵（大概是整数）


作者（S）----------Author(s)----------


Mark Robinson, Davis McCarthy



参见----------See Also----------

DGEList for more information about the DGEList class. as.matrix.DGEList.
DGEListDGEList类的更多信息。 as.matrix.DGEList。


举例----------Examples----------


# generate raw counts from NB, create list object[来自NB生成的原始计数，创建列表对象]
y<-matrix(rnbinom(20,size=1,mu=10),nrow=5)
d<-DGEList(counts=y,group=rep(1:2,each=2),lib.size=rep(c(1000:1001),2))
# should be 5x4[应该是5X4]
print(dim(getCounts(d)))

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注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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