R语言 ecolitk包 ecoli.m52.genome()函数中文帮助文档(中英文对照)

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ecoli.m52.genome(ecolitk)
ecoli.m52.genome()所属R语言包：ecolitk

                                         Escherichia coli data
                                         大肠杆菌数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Meta-data related to Escherichia coli
元数据相关的大肠杆菌


用法----------Usage----------


data(ecoli.m52.genome)
data(ecoligenomeCHRLOC)
data(ecoligenomeSYMBOL2AFFY)
data(ecoligenomeSYMBOL)
data(ecoligenomeSTRAND)
data(ecoligenome.operon)
ecoli.len



格式----------Format----------

The format for ecoli.m52.genome is character with genome sequence. The format for ecoligenomeCHRLOC is an environment (as a hash table). Each key is an Affyemtrix probe set ID, and each value is vector of two integers (begining and end - see the details below) The format for ecoligenomeSYMBOL2AFFFY is an environment (as a hash table). Each key is a gene symbol name. The format for ecoligenomeSYMBOL is an environment (as a hash table). Each key is an Affymetrix probe set id ecoli.len is a variable containing the size of the genome in ecoli.m52.genome.
ecoli.m52.genome是character基因组序列的格式。的ecoligenomeCHRLOC格式是一个环境（如哈希表）。每个关键是一个Affyemtrix探针组ID，每个值是两个整数（begining和结束 - 看下面的详细信息）的矢量格式为ecoligenomeSYMBOL2AFFFY是一个环境（如哈希表）。每个键都是一个基因符号的名称。的ecoligenomeSYMBOL格式是一个环境（如哈希表）。每个键是一个Affymetrix的探针设置IDecoli.len是一个变量，包含在ecoli.m52.genome基因组的大小。


Details

详情----------Details----------

The environments ecoligenomeSYMBOL2AFFFY and ecoligenomeSYMBOL are like the ones in the data packages built by annBuilder.
环境ecoligenomeSYMBOL2AFFFY和ecoligenomeSYMBOL像在annBuilder内置的数据包的。

The environment ecoligenomeCHRLOC differs: two integers are associated with each key, one corresponds to the begining of the segment the other to the end.
环境ecoligenomeCHRLOC不同：两个整数与每个键关联的，一个对应的段年底begining。

The environment ecoligenomeSTRAND returns a logical. TRUE means that the orientation is "+", FALSE means that the orientation is '-' (and NA is used when irrelevant for the key).
的的环境ecoligenomeSTRAND返回logical。 TRUE指的方向是“+”，FALSE意味着方向是 - （NA时使用的关键无关）。


源----------Source----------

http://www.genome.wisc.edu/sequencing/k12.htm and http://www.biostat.harvard.edu/complab/dchip/info_file.htm
http://www.genome.wisc.edu/sequencing/k12.htm和http://www.biostat.harvard.edu/complab/dchip/info_file.htm


举例----------Examples----------


data(ecoli.m52.genome)



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