R语言 dualKS包 dksSelectGenes()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

dksSelectGenes(dualKS)
dksSelectGenes()所属R语言包：dualKS

                                         Extract gene signatures from a DKSGeneScores object.
                                         提取物从DKSGeneScores对象的基因签名。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The DKSGeneScores returned by dksTrain holds  the rank data for all the genes in the original ExpressioSet.  However, generally only the top n genes for each class are desired  for classification.  Rather than needing to re-run dksTrain  every time a signature of different size (n) is desired, you  simply extract that top n genes from this object using dksSelectGenes.
DKSGeneScores返回dksTrain拥有所有的基因在原来的ExpressioSet排名数据。然而，一般只为每个类的前n个基因需要进行分类。而不需要重新运行dksTrain每一个不同的大小（N）的签名所需的时间，你只需提取从这个使用dksSelectGenes对象的前n基因。


用法----------Usage----------


dksSelectGenes(data, n)



参数----------Arguments----------

参数：data
An object of class DKSGeneScores, typically generated by dksTrain
类DKSGeneScores的对象，通常产生dksTrain


参数：n
The number of genes, per class, to include in the classification  signature.
的基因数量，每类，包括在分类签名。


值----------Value----------

An object of class DKSGeneScores
一个对象的类DKSGeneScores


作者（S）----------Author(s)----------


Eric J. Kort, Yarong Yang



参见----------See Also----------

dksTrain, dksSelectGenes, dksClassify, DKSGeneScores, DKSPredicted,
dksTrain，dksSelectGenes，dksClassify，DKSGeneScores，DKSPredicted


举例----------Examples----------


        data("dks")
        tr <- dksTrain(eset, 1, "up")
        cl <- dksSelectGenes(tr, 100)
        pr <- dksClassify(eset, cl)
        summary(pr, pData(eset)[,1])
        show(pr)
        plot(pr, actual=pData(eset)[,1])       

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