R语言 DOSE包 enrichDO()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

enrichDO(DOSE)
enrichDO()所属R语言包：DOSE

                                        DO Enrichment Analysis of a gene set.
                                         富集的基因组分析。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Given a vector of genes, this function will return the enrichment DO categories with FDR control.
鉴于此功能的基因向量，将返回的富集与FDR控制类别。


用法----------Usage----------


        enrichDO(gene, organism="human", pvalueCutoff = 0.05)



参数----------Arguments----------

参数：gene
a vector of entrez gene id.  
Entrez基因身份证向量。


参数：organism
Currently, only "human" and "mouse" supported.  
目前，只有“人”和“鼠标”的支持。


参数：pvalueCutoff
Cutoff value of pvalue.  
临界值pvalue。


值----------Value----------

A enrichDOResult instance.
一个enrichDOResult实例。


参见----------See Also----------

enrichDOResult-class,
enrichDOResult-class


举例----------Examples----------


        set.seed(123)
        data(EG2DO)
        gene = sample(names(EG2DO), 30)
        yy = enrichDO(gene, pvalueCutoff=0.05)
        summary(yy)

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