segments.summary(DNAcopy)
segments.summary()所属R语言包:DNAcopy
Additional summary measured for the segments
测量分部额外摘要
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This program computes the standard deviation, median and the mad of the data for each segment found by the CBS algorithm.
此方案计算标准差,中位数和各分部的数据由CBS算法发现的疯狂。
用法----------Usage----------
segments.summary(x)
参数----------Arguments----------
参数:x
an object of class DNAcopy
一个类DNAcopy的对象
值----------Value----------
a data frame with nine columns. The sd, median and mad of each segment is added to the six columns from the segment command.
与九路纵队的数据框。 SD,中位数和各分部疯狂添加到六个段命令列。
作者(S)----------Author(s)----------
Venkatraman E. Seshan
举例----------Examples----------
# test code on an easy data set[一个简单的数据集上的测试代码]
set.seed(25)
genomdat1 <- rnorm(500, sd=0.1) +
rep(c(-0.2,0.1,1,-0.5,0.2,-0.5,0.1,-0.2),c(137,87,17,49,29,52,87,42))
genomdat2 <- rnorm(500, sd=0.1) +
rep(c(-0.2,0.1,1,-0.5,0.2,-0.5,0.1,-0.2),c(137,87,17,49,29,52,87,42))
genomdat1[sample(1:500,5)] <- NA
chrom <- rep(1:2,c(290,210))
maploc <- c(1:290,1:210)
test1 <- segment(CNA(cbind(genomdat1,genomdat2), chrom, maploc))
segments.summary(test1)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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