glFrequency(DNAcopy)
glFrequency()所属R语言包:DNAcopy
Additional summary measured for the segments
测量分部额外摘要
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This program computes the frequency of gains and losses for each probe as a function of level of mad.
此方案计算每个探针作为一个疯狂的功能水平的收益和损失的频率。
用法----------Usage----------
glFrequency(xout, threshold=1)
参数----------Arguments----------
参数:xout
an object of class DNAcopy
一个类DNAcopy的对象
参数:threshold
threshold value to call gain or loss
阈值调用收益或亏损
值----------Value----------
A segment is called a gain or loss if the segment mean is at least the threshold* mad distance away from the median copy number level. The output is a data frame with five columns which give the chromosome (chrom), genomic position (maploc), the number of samples with available data (pfreq), and the gain (gain) and loss (loss).
A段被称为收益或亏损,如果该段平均至少阈值*疯狂的距离从拷贝数的中位数水平。输出的是一个具有五列,这给(铬)染色体,基因组的位置(maploc),样本数量(pfreq)提供的数据,和增益(增益)和损失(损失)的数据框。
作者(S)----------Author(s)----------
Venkatraman E. Seshan
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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