DNAcopy(DNAcopy)
DNAcopy()所属R语言包:DNAcopy
Results of segmenting a CNA data object
中央社数据对象的分割结果
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The results of segmenting data from copy number array experiments from programs such as circular binary segmentation (CBS).
如循环二元分割(CBS)的节目套数阵列实验数据分割的结果。
用法----------Usage----------
## S3 method for class 'DNAcopy'
print(x, showSegRows=FALSE, ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
an object of class DNAcopy – output of segment.
- 类DNAcopy段输出对象。
参数:showSegRows
option to show row numbers for the segment start and end. default is FALSE.
选项,以显示行号段的开始和结束。默认为false。
参数:...
arguments to be passed onto print command called within.
参数被传递到内调用打印命令。
Details
详情----------Details----------
An object of class DNAcopy. There is a print method that prints the results in a tabular format. Each row gives the sample, the chromosome, the start and end map locations, the number of markers and the mean of each segment.
对象类DNAcopy。有print方法以表格形式打印结果。每一行提供的样品,染色体,开始和结束的图位置,标记的数量和每个段的平均值。
值----------Value----------
参数:data
The original CNA object which was the input for segment
段输入的原始中央社对象
参数:ID
sample identifier.
样品标识。
参数:chrom
the chromosome within the sample.
样本内的染色体。
参数:loc.start
the starting map location of the segment
段的开始位置图
参数:loc.end
the ending map location of the segment
该段结束的图位置
参数:num.mark
the number of markers in the segment
在该段标记
参数:data.type
the segment mean.
该段的意思。
参数:call
the call that produced the object.
调用产生的对象。
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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