R语言 DiffBind包 dba.plotVenn()函数中文帮助文档(中英文对照)

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dba.plotVenn(DiffBind)
dba.plotVenn()所属R语言包：DiffBind

                                         Draw 2-way or 3-way Venn diagrams of overlaps
                                         2路或3路维恩图绘制重叠

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Draws 2-way or 3-way Venn diagrams of overlaps
绘制重叠2路或3路维恩图


用法----------Usage----------


dba.plotVenn(DBA, mask, overlaps, label1, label2, label3, ...)



参数----------Arguments----------

参数：DBA
DBA object; if present, only the mask parameter will apply.  
DBA的对象，如果存在的话，只有面具参数将适用。


参数：mask
mask or vector of peakset numbers indicating which peaksets to include in Venn diagram. Only 2 or 3 peaksets should be included.  See dba.mask. Only one of mask or overlaps is used.  
面罩或矢量peakset数字表明包括哪些peaksets以维恩图。只有2或3 peaksets，应包括在内。看到dba.mask。只有一个面具或重叠使用。


参数：overlaps
overlap record, as computed by dba.overlap(Report=DBA_OLAP_PEAKS).  Only one of mask or overlaps is used.  
重叠的记录，计算由dba.overlap（报告= DBA_OLAP_PEAKS）。只有一个面具或重叠使用。


参数：label1
label for first peakset in diagram  
图中的第一peakset标签


参数：label2
label for second peakset in diagram  
图中的第二peakset标签


参数：label3
label for third peakset in diagram  
图中的第三peakset标签


参数：...
arguments passed on to vennDiagram{limma}  
参数传递到vennDiagram {limma}


作者（S）----------Author(s)----------



Rory Stark




举例----------Examples----------


data(tamoxifen_peaks)

par(mfrow=c(2,2))
# 2-way Venn[2，方式维恩]
dba.plotVenn(tamoxifen,6:7)
dba.plotVenn(tamoxifen,tamoxifen$masks$ZR75)

# 3-way Venn (done two different ways)[3路维恩（做了两种不同的方式）]
dba.plotVenn(tamoxifen,tamoxifen$masks$MCF7)
olaps = dba.overlap(tamoxifen,tamoxifen$masks$MCF7)
dba.plotVenn(tamoxifen,overlaps=olaps,
             label1="Rep 1",label2="Rep 2",label3="Rep 3",main="MCF7 Replicates")

#Venn of overlaps[维恩重叠]
Responsive=dba(tamoxifen,tamoxifen$masks$Responsive)
Responsive
Responsive = dba.peakset(Responsive,1:3,sampID="MCF7")
Responsive = dba.peakset(Responsive,4:5,sampID="T47D")
Responsive = dba.peakset(Responsive,6:7,sampID="ZR75")
dba.plotVenn(Responsive,Responsive$masks$Consensus)


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