R语言 DEXSeq包 estimatelog2FoldChanges()函数中文帮助文档(中英文对照)

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estimatelog2FoldChanges(DEXSeq)
estimatelog2FoldChanges()所属R语言包：DEXSeq

                                        Fold changes (log2) from the fitted expression values in the GLM.
                                         倍的变化（log2）的GLM的拟合表达式的值。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function calculates the fold changes (on log2 scale) between the different conditions. It calculates them from the coefficients of a GLM that fits the read counts to a variable of the experimental design specified  by the user (see below, parameter "fitExpToVar").
此函数计算倍之间的不同条件的变化（log2对数值）。它从一个系数的GLM适合读计数由用户指定的变量的实验设计（见下文参数“fitExpToVar”）的计算。


用法----------Usage----------


estimatelog2FoldChanges(ecs, fitExpToVar="condition",
          nCores=1, quiet=FALSE, file="")



参数----------Arguments----------

参数：ecs
An ExonCountSet object.  
一个ExonCountSet的对象。


参数：fitExpToVar
A variable contained in design(ecs). The expression  values will be fitted to this variable using the the formula  "count ~ sample + fitExpToVar * exon".  
变量包含在design(ecs)。表达式的值将被安装到这个变量使用的计数公式“~样品+ fitExpToVar *外显子”。


参数：nCores
Number of CPU cores to be used to estimate the dispersions.   The multicore package need to be loaded beforehands to parallelize over several cores.  
被用来估计分散的CPU核心的数量。 multicore包需要，装beforehands并行在几个核心。


参数：quiet
If TRUE, no progress report is shown.  In case the session is  not an interactive and progress report is wanted, add a file name below.  
如果是TRUE，没有取得任何进展报告所示。在情况下，会话不会被通缉的互动和进度报告，添加下面的一个文件名。


参数：file
A file name to write the progress reports. If file="", output will be written to the standard output connection.  
一个文件名，写进度报告。如果文件“，输出将被写入到标准输出连接。


举例----------Examples----------


     ## Not run: [＃无法运行：]
         data("pasillaExons", package="pasilla")
         pasillaExons <- estimateSizeFactors( pasillaExons )
         pasillaExons <- estimateDispersions( pasillaExons )
         pasillaExons <- fitDispersionFunction( pasillaExons )
         pasillaExons <- estimatelog2FoldChanges( pasillaExons )
     
## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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注：
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