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R语言 DEXSeq包 counts()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 16:33:48 | 显示全部楼层 |阅读模式
counts(DEXSeq)
counts()所属R语言包:DEXSeq

                                         Accessors for the 'counts' slot of a ExonCountSet object.
                                         访问器的“罪名”一个ExonCountSet对象插槽。

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The counts slot holds the count data as a matrix of non-negative integer count values, one row for each observational unit (a counting bin, i.e., an exon or part of an exon), and one column for each sample.
计数槽拥有作为一个非负整数计数的值,每个观察单位(点票箱,即外显子或外显子的一部分),和一列,每个样品一行矩阵的计数数据。


用法----------Usage----------


## S4 method for signature 'ExonCountSet'
counts(object, normalized=FALSE)
## S4 replacement method for signature 'ExonCountSet,matrix'
counts(object) <- value



参数----------Arguments----------

参数:object
An ExonCountSet object.
一个ExonCountSet的对象。


参数:normalized
If TRUE, the counts will be normalized by the size factors.
如果是TRUE,计数将标准化的大小因素。


参数:value
An integer matrix of counts, each row corresponding to an exon and each column corresponding to a sample.
计数的整数矩阵,每一行对应一个外显子和每一列对应一个样本。


举例----------Examples----------


   data("pasillaExons", package="pasilla")
   head( counts( pasillaExons ) )

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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