R语言 DESeq包 getBaseMeansAndVariances()函数中文帮助文档(中英文对照)

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getBaseMeansAndVariances(DESeq)
getBaseMeansAndVariances()所属R语言包：DESeq

                                         Perform row-wise estimates of base-level means and variances for count data.
                                         执行行明智的估计水平基本手段和计数资料差异。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function is called internally by a number of other functions. You will need to call it directly only in very special cases.
此功能被称为国内的其他功能。你会需要只有在非常特殊的情况下，它直接调用。


用法----------Usage----------


getBaseMeansAndVariances(counts, sizeFactors)



参数----------Arguments----------

参数：counts
a matrix of data frame of count data. All the columns of this matrix will be considered as replicates of the same condition.  
计数数据的数据框的矩阵。这个矩阵的所有列将被视为相同的条件下进行复制。


参数：sizeFactors
the size factors of the columns, as estimated e.g. with estimateSizeFactorsForMatrix  
列的大小因素，如估计如以estimateSizeFactorsForMatrix


Details

详情----------Details----------

This function is kept for backwards compatibility. See the example below for an alternative and more self-explanatory way to get the same data.
这个功能是保持向后兼容性。请看下面的例子为另一种更不言自明的方式来获得相同的数据。


值----------Value----------

A data frame with one row for each row in 'counts' and two columns:
与一排在“计数”和两列的每一行数据框：


参数：baseMean
The base mean for each row. This is the mean of the counts after they have been divided by the size factors
该碱基是指每一行。这是计数的平均分为大小因素后，他们已


参数：comp2
The base variance for each row. This is the variance of the counts after they have been divided by the size factors
每一行的基础差异。这是计数的差异后，他们已划分的大小因素


作者（S）----------Author(s)----------



Simon Anders, sanders@fs.tum.de




举例----------Examples----------


cds <- makeExampleCountDataSet()
cds <- estimateSizeFactors( cds )
head( getBaseMeansAndVariances( counts(cds), sizeFactors(cds) ) )

# You can get the same as follows[你可以得到如下]
head( rowMeans( counts( cds, normalized=TRUE ) ) )
head( genefilter::rowVars( counts( cds, normalized=TRUE ) ) )

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