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R语言 ChromHeatMap包 cytobands()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 15:04:03 | 显示全部楼层 |阅读模式
cytobands(ChromHeatMap)
cytobands()所属R语言包:ChromHeatMap

                                        Cytoband location information
                                         cytoband位置信息

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This data set contains cytoband information for a range of species, taken directly from the UCSC genome annotation database. This data set is designed to be easily extendable to cover new species.
该数据集包含一个物种的范围内,采取直接从UCSC基因组注释数据库,cytoband信息。该数据集的设计很容易地扩展到包括新物种。


用法----------Usage----------


cytobands



格式----------Format----------

A list of data frames, one per species, each with one row per cytoband and the following columns:
一个数据框,每个物种之一,每个一行每cytoband和下面的列列表:

chrThe chromosome number for the cytoband, prefixed with 'chr'.
为cytoband chrThe染色体数目,与“CHR”前缀。

startThe start coordinate for the cytoband.
startThe开始的cytoband协调。

endThe end coordinate for the cytoband.
endThe为cytoband结束坐标。

bandThe cytoband number (i.e., the '23.3' in '1q23.3').
bandThe cytoband数量(即,在23 .3,1 q23.3“)。

stainThe cytoband stain (see the stains data set).
stainThe cytoband染色(见stains数据集)。

armThe chromosome arm for the cytoband (i.e., the 'q' in '1q23.3').
armThe为cytoband染色体臂(即Q,1 q23.3)。

The list names (i.e. names(cytobands)) should correspond to species names in the AnnotationDbi packages used.
列表名称(即names(cytobands))应符合物种在的AnnotationDbi使用的软件包名称。


源----------Source----------

The UCSC genome annotation database: http://hgdownload.cse.ucsc.edu/downloads.html
UCSC基因组注释数据库:http://hgdownload.cse.ucsc.edu/downloads.html

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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