R语言 chopsticks包 read.wtccc.signals()函数中文帮助文档(中英文对照)

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read.wtccc.signals(chopsticks)
read.wtccc.signals()所属R语言包：chopsticks

                                         read normalized signals in the WTCCC signal
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                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

read.wtccc.signals takes a file and a list of snp ids (either Affymetrix ProbeSet IDs or rs numbers), and extract the entries into a form suitable for plotting and further analysis  
read.wtccc.signals需要的文件和SNP IDS（无论是Affymetrix公司ProbeSet ID或RS数字）的列表，并提取成一种合适的图，并进一步分析条目


用法----------Usage----------


read.wtccc.signals(file, snp.list)



参数----------Arguments----------

参数：file
file contains the signals. There is no need to gunzip.
file包含的信号。有没有必要用gunzip。


参数：snp.list
A list of snp id's. Some Affymetrix SNPs don't have rsnumbers both rsnumbers and Affymetrix ProbeSet IDs are accepted
SNP ID的列表。一些Affymetrix的单核苷酸多态性没有rsnumbers的同时的rsnumbers和Affymetrix公司ProbeSet ID被接受


Details

详情----------Details----------

Do not specify both rs number and Affymetrix Probe Set ID in the input; one of them is enough.
不指定RS数量和Affymetrix的探针设置在输入ID，其中一人是足够了。

The signal file is formatted as follows, with the first 5 columns being the Affymetrix Probe Set ID, rs number, chromosome position, AlleleA and AlleleB. The rest of the header containing the sample id appended with "\_A" and "\_B".
信号文件的格式如下，第5列的Affymetrix探针集ID，RS，染色体位置，AlleleA和AlleleB。头含有“\ _A”和“\ _B”追加样品编号的其余部分。


值----------Value----------

The routine returns a list of named matrices, one for each input SNP (NULL if the SNP is not found); the row names are sample IDs and columns are "A", "B" signals.
例程返回一个名为矩阵列表，每个输入的SNP（NULL如果没有发现的SNP）;行名称，样品ID列是“A”，“B”信号。


注意----------Note----------

TODO: There is a built-in limit to the input line buffer (65535) which should be sufficient for 2000 samples and 30 characters each. May want to seek backwards, re-read and dynamically expand if the buffer is too small.
TODO：在有一个内置的输入缓冲区（65535），这应该足以为2000个样本，每组30个字符的限制。可能要寻求向后，重新阅读和动态扩展，如果缓冲区太小。


作者（S）----------Author(s)----------


Hin-Tak Leung <a href="mailto:htl10@users.sourceforge.net">htl10@users.sourceforge.net</a>



参考文献----------References----------

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注：
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