R语言 chopsticks包 pair.result.ld.snp()函数中文帮助文档(中英文对照)

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pair.result.ld.snp(chopsticks)
pair.result.ld.snp()所属R语言包：chopsticks

                                         Function to calculate the pairwise  D', $r^2$, LOD of
                                         函数计算成对D“，$ R ^ 2的LOD

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

pair.result.ld.snp.Rd calculates the pairwise D', $r^2$, LOD of a pair of specified SNPs in a snp.matrix object. This is used mainly for debugging.
pair.result.ld.snp.Rd计算成对D“，$ R ^ 2美元，对指定的单核苷酸多态性的LODsnp.matrix对象。这主要是用来调试。


用法----------Usage----------


pair.result.ld.snp(snpdata, loc.snpA, loc.snpB)



参数----------Arguments----------

参数：snpdata
An object of snp.matrix class with M samples of N snps
一个snp.matrixM样点的N个SNPs类的对象


参数：loc.snpA
index of the first snp; should be between 1 and N
1和N之间应该第一SNP指数;


参数：loc.snpB
index of the second snp; should be between 1 and N
1和N之间应该是第二个SNP指数;


值----------Value----------

Returns nothing. Results are displayed in stdout/console.  
返回Nothing。结果显示在标准输出/控制台。


注意----------Note----------

Not really recommended for daily usage; the result isn't saved anywhere and this routine is primarily for debugging the details and correctness of the calculation.
建议日常使用没有真正的结果不会被保存在任何地方，这个程序主要是用于调试的详细信息和计算的正确性。


作者（S）----------Author(s)----------


Hin-Tak Leung <a href="mailto:htl10@users.sourceforge.net">htl10@users.sourceforge.net</a>



参考文献----------References----------

whole-genome association studies.  Human Heredity 64:45-51.<br> GSL (GNU Scientific Library) http://www.gnu.org/software/gsl/

参见----------See Also----------

snp.matrix-class
snp.matrix-class


举例----------Examples----------


data(testdata)
pair.result.ld.snp(Autosomes, 1, 2)

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