R语言 chipseq包 peakCutoff()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

peakCutoff(chipseq)
peakCutoff()所属R语言包：chipseq

                                         Calculate a peak cutoff
                                         计算峰值截止

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Calculates a peak cutoff value given an FDR, assuming a Poisson noise distribution estimated from the frequency of singleton and doubleton islands.
计算峰值的临界值，给FDR，假设泊松噪声的单身人士和二人岛屿的频率分布估计。


用法----------Usage----------


peakCutoff(cov, fdr.cutoff = 0.001, k = 2:20)



参数----------Arguments----------

参数：cov
The coverage object, e.g., an RleList object.  
报道的对象，例如，RleList对象。


参数：fdr.cutoff
The maximum-allowed FDR for calculating the cutoff.  
最大允许的计算截止FDR。


参数：k
The coverage levels at which to estimate an FDR value. The maximal value that is less than fdr.cutoff is chosen for calculating the cutoff. Usually best left to the default.  
覆盖水平估计FDR价值。最大的价值比fdr.cutoff选择计算截止。一般最好留给默认。


值----------Value----------

A numeric value to use for calling peaks
一个数值，用于调用峰


作者（S）----------Author(s)----------



D. Sarkar and M. Lawrence




参见----------See Also----------

islandDepthPlot for the graphical equivalent; the vignette for a bit more explanation.
islandDepthPlot等价的图形;暗角更多的解释。


举例----------Examples----------


data(cstest)
cov <- coverage(resize(cstest$ctcf, width=200))
peakCutoff(cov)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。