R语言 SNPRelate包 snpgdsSNPList()函数中文帮助文档(中英文对照)

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snpgdsSNPList(SNPRelate)
snpgdsSNPList()所属R语言包：SNPRelate

                                         Create a SNP list object
                                         建立SNP名单对象

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A list object of SNP information including rs, chr, pos, allele and allele frequency.
一个List对象的SNP信息，包括RS，字符，POS机，等位基因和等位基因频率。


用法----------Usage----------


snpgdsSNPList(gdsobj, sample.id=NULL)



参数----------Arguments----------

参数：gdsobj
the gdsclass object in the gdsfmt package
gdsclass对象在gdsfmt包


参数：sample.id
a vector of sample id specifying selected samples; if NULL, all samples are used
一个向量的样品ID指定选取的样本，如果为NULL，所有样本都


值----------Value----------

Return an object of “snpgdsSNPListClass” including the following components:
返回一个对象的“snpgdsSNPListClass”，包括以下组成部分：


参数：rs.id
SNP id
SNP ID


参数：chromosome
SNP chromosome index
SNP染色体指数


参数：position
SNP physical position in basepair
SNP物理位置的碱基对组成的


参数：allele
reference / non-ref alleles
参考/非文献等位基因


参数：afreq
allele frequency
等位基因频率


（作者）----------Author(s)----------


Xiuwen Zheng <a href="mailto:zhengx@u.washington.edu">zhengx@u.washington.edu</a>



参见----------See Also----------

snpgdsSNPListIntersect, snpgdsSNPListStrand
snpgdsSNPListIntersect，snpgdsSNPListStrand


实例----------Examples----------


# open an example dataset (HapMap)[打开示例数据集（人类基因组单体型图）]
genofile <- openfn.gds(snpgdsExampleFileName())

# to get a snp list object[获得SNP列表对象]
snplist <- snpgdsSNPList(genofile)

# close the genotype file[关闭基因型文件]
closefn.gds(genofile)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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