R语言 simecol包 chemostat()函数中文帮助文档(中英文对照)

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chemostat(simecol)
chemostat()所属R语言包：simecol

                                        Chemostat Model
                                         恒化器模型

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

simecol example: Model of continuos culture of microorganisms (chemostat).
simecol例如：产品的微生物连续培养（恒化器）。


用法----------Usage----------


data(chemostat)



格式----------Format----------

An S4 object according to the odeModel specification. The object contains the following slots:
S4的对象根据odeModel规格的。该对象包含以下插槽：




main the differential equations for substrate (S) and cells (X).
main微分方程基板（S）和单元（X）。




parms a vector with the named parameters of the model:
parms一个向量，其命名参数的模型：




vm maximum growth rate of the cells,
vm最大生长速率的单元，




km half saturation constant,
km半饱和常数，




Y yield coefficient (conversion factor of substrate into cells).
Y的产率系数（转换因子的底物进入单元）。




D dilution rate,
D贫化率，




S0 substrate concentration in the inflow.
S0底物浓度的流入。




times simulation time and integration interval.
times仿真时间和积分区间。




init vector with start values for substrate (S) and cells (X).
init矢量与起始值基板（S）和单元（X）。

To see all details, please have a look into the implementation below.
要查看所有详细信息，请看看下面进入实施。


参见----------See Also----------

simecol-package, sim, parms, init, times.
simecol-package，sim，parms，init，times。


实例----------Examples----------


##============================================[＃============================================]
## Basic Usage:[＃的基本用法：]
##   work with the example[＃与范例]
##============================================[＃============================================]
data(chemostat)
plot(sim(chemostat))

parms(chemostat)["D"] <- 0.9
plot(sim(chemostat))



##============================================[＃============================================]
## Implementation:[＃实现：]
##   The code of the chemostat model[＃代码的恒化器模型]
##============================================[＃============================================]
chemostat <- new("odeModel",
  main = function(time, init, parms, inputs = NULL) {
    with(as.list(c(init, parms)), {
      mu  &lt;- vm * S/(km + S)              # Monod equation[Monod方程]
      dx1 &lt;- mu * X - D * X               # cells, e.g. algae[单元，例如藻类]
      dx2 &lt;-  D *(S0 - S) - 1/Y * mu * X  # substrate, e.g. phosphorus[基板，例如磷]
      list(c(dx1, dx2))
    })
  },
  parms = c(
    vm = 1.0,           # max growth rate, 1/d[最大的增长速度，1次/ d]
    km = 2.0,           # half saturation constant, mumol / L[半饱和常数，μmol/ L的]
    Y  = 100,           # cells /mumol Substrate[单元/ mumol基板]
    D  = 0.5,           # dilution rate, 1/d[稀释率，1次/ d;]
    S0 = 10             # substrate in inflow, mumol / L[μmol/ L的基板流入，]
  ),
  times = c(from=0, to=40, by=.5),
  init  = c(X=10, S=10), # cells / L; Substrate umol / L[单元/ L，底物微摩尔/ L的]
  solver = "lsoda"
)


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