mama(simba)
mama()所属R语言包:simba
A (convenience) wrapper function to make matrix from a data.frame
A(方便)包装函数矩阵数据框
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The function mama uses reshape to transpose species data given in database list format (where each line represents a species in a plot, so the list has three columns containing information on plot, species and information on occurence) into a plot species matrix (where rows represent plots and columns represent species) for further use with other functions on vegetational data.
的功能mama使用reshape调换的物种数据在数据库列表格式(其中的每一行代表一个物种的图,所以列表中有三列载有关于上发生的图,物种和信息的)成积的物种矩阵(代表图的行和列代表种)为进一步利用与植被数据的其他功能。
用法----------Usage----------
mama(dat, spl = TRUE)
参数----------Arguments----------
参数:dat
Species data in list format. The columns have to represent plot, species, occurence information (presence/absence or abundances). Column names may differ but they must be in that order! The last column can be missing when these are presence/absence data
种数据以列表格式。列代表的图,种类,发生信息(存在/不存在或丰度)。列名可能会有所不同,但他们必须按照这个顺序!时,这些都是存在/不存在数据的最后一列中可以缺少
参数:spl
Logical. If TRUE (default) mama assumes that the input is species data and formats the output accordingly
逻辑。如果是TRUE(默认情况下)mama的假设的物种数据的输入和输出的格式
Details
详细信息----------Details----------
You could reach the same result with reshape. I was just always quite confused with this. That's why i decided to do this little wrapper for convenience. It needs quite a while to run though, but this is due to reshape.
与reshape你可以达到同样的效果。我只是一直很困惑这个问题。这就是为什么我决定做这个小包装方便。虽然需要相当长的时间来运行,但是,这是由于reshape。
值----------Value----------
Returns a data.frame which contains the presence/absence or abundance data of the species list. Rows represent plots, columns represent species. If you want to have it vice versa you have to use the function on a list with columns species, plots, occurrence information (in that order).
返回data.frame其中包含存在/不存在的物种列表或丰度数据。行表示图,柱代表种。如果你想拥有它,反之亦然,你必须使用的功能列表列species,plots,occurrence information(按顺序)。
(作者)----------Author(s)----------
Gerald Jurasinski
参见----------See Also----------
reshape, data.frame
reshape,data.frame
实例----------Examples----------
data(abis)
abis.spcls <- liste(abis.spec, splist=TRUE)
## see the list, it like what you get from a database[#见列表,它就像你从一个数据库]
## and return to matrix-format:[#并返回以矩阵格式:]
abis.test <- mama(abis.spcls)
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