findprobe(seqRFLP)
findprobe()所属R语言包:seqRFLP
Find probes matching sites
探针匹配站点
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function could be used to search probes (primer) matching sites. Users may lower the tol value to get more precise match result.
此功能可以用来匹配的搜索探针(底漆)网站。用户可能会降低公差值,以获得更精确的匹配结果。
用法----------Usage----------
findprobe(dna, probe, tol = 3)
参数----------Arguments----------
参数:dna
The input DNA sequence.
输入的DNA序列。
参数:probe
The probe(primer) to match the DNA sequence.
的探针(引物),以匹配的DNA序列。
参数:tol
The number of sites that do not match
网站的数量不匹配
Details
详细信息----------Details----------
dna should be a character string. tol is used to adjust the matching precision and should be integer. The smaller the number, the more precise the matching results. This function is called by clipprobe()
dna应该是一个字符串。 tol被用于调整匹配精度,并应该是整数。的数目越小,更精确的匹配结果。此功能称为clipprobe(),
值----------Value----------
Returns a vector containing the matched sites.
返回一个向量,包含匹配的网站。
注意----------Note----------
To be added.
无以复加。
(作者)----------Author(s)----------
Qiong Ding <a href="mailto:dingqiong1@gmail.com">dingqiong1@gmail.com</a>
参考文献----------References----------
None.
参见----------See Also----------
See Also clipprobe
请参见clipprobe
实例----------Examples----------
### findprobe() example[##findprobe()的例子]
data(fil.phy)
fas <- ConvFas(fil = fil.phy, type = "phy")
findprobe(dna = fas[2], probe = "TATTTAAC", tol = 1)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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