R语言 seqinr包 plot.SeqAcnucWeb()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plot.SeqAcnucWeb(seqinr)
plot.SeqAcnucWeb()所属R语言包：seqinr

                                        To Plot Subsequences on the Parent Sequence
                                         要绘制父序列的子序列

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function plots all the type of subsequences on a parent sequence. Subsequences are represented by colored rectangle on the parent sequence.  For example, types could be CDS, TRNA, RRNA .... In order to get all the types that are available for the selected database, use getType.
此功能的所有类型的父序列的子序列图。父序列，子序列为代表的彩色矩形。例如，类型可以是CD，氨酰tRNA，rRNA的....为了获得可用于选定的数据库的所有类型，使用getType。


用法----------Usage----------


## S3 method for class 'SeqAcnucWeb'
plot(x, types = getType()$sname, socket = autosocket(), ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
A sequence of class SeqAcnucWeb
序列类SeqAcnucWeb


参数：types
The type of subsequences to plot. Default value is to consider all possible subsequence types.
该类型的子序列的图。默认值是考虑所有可能的序列类型。


参数：socket
an object of class sockconn connecting to a remote ACNUC database (default is a socket to the last opened database).
对象的类sockconn连接到一个的远程ACNUC数据库（默认值是一个socket的最后一个打开的数据库）。


参数：...
not currently used        
当前未使用


值----------Value----------

An invisible list giving, for each subsequence, its position on the parent sequence.
有一条无形的列表，每个子序列，给父序列上的位置。


（作者）----------Author(s)----------


D. Charif and J.R. Lobry



参考文献----------References----------




参见----------See Also----------

getType, query
getType，query


实例----------Examples----------


## Not run:  [＃不运行：]
  ### Need internet connection[＃＃需要互联网连接]
  choosebank("hovernucl")
  query("list", "AC=AB000425")       
  plot(list$req[[1]])
  
## End(Not run)[＃（不执行）]

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