R语言 annaffy包 aafTable-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

aafTable-class(annaffy)
aafTable-class()所属R语言包：annaffy

                                        Class aafTable, a tabular microarray data class
                                         表格芯片数据类类aafTable

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A class for storing and flexible output of microarray data to HTML and text formats.
A类为HTML和文本格式的微阵列数据的存储和灵活的输出。


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects are generally created by any of the annotation table constructors that are also part of this package. Objects can also be created manually  by calls of the form new("aafList", probeids, table).
对象一般都是创建任何注释表构造，也是这个包的一部分。对象也可以手动创建检测形式new("aafList", probeids, table)。


插槽----------Slots----------

Object of class character containing the probe ids for each row of the table.
Object类的character表的每一行包含探针IDS。

Object of class list containing aafList objects all of the same length, representing the columns of the table. Each item in the list must have a unique name.
Object类的list含aafList对象代表表中的列的长度相同，所有。列表中的每个项目都必须有一个唯一的名称。


方法----------Methods----------

(aafTable): Returns a character vector containing the probe ids for each row of the table.
（aafTable）：返回一个表的每一行包含探针IDS的特征向量。

(aafTable): Sets the probe ids for the table rows. Can be set to character(0) if unknown or not applicable.
（aafTable）：设置探针IDS表中的行。可以设置character(0)如果未知或不适用。

(aafTable): Returns a character vector containing the names of the columns stored in the table.
（aafTable）：返回一个字符向量存储在表中的列名。

(aafTable): Set the column names for the table. Each must be unique.
（aafTable）：设置为表的列名。每个人都必须是唯一的。

(aafTable): Returns the dimensions of the table.
（aafTable）：返回表的尺寸。

(aafTable, aafTable, all = FALSE, all.x = all, all.y = all,  suffixes = c(".x",".y")): Merges two tables together, aligning common probe ids if possible. Duplicate column names are given suffixes to make them unique. Returns the merged table.
（aafTable，aafTable，所有all.x = FALSE =所有，all.y =所有后缀= C（“X”），“Y”）：合并两个表，对准普通探针IDS如果可能的话。重复的列名的后缀，使他们的独特。返回合并后的表。

(aafTable, aafTable, ...): Vertically combines tables by row. Requires that column names be identical and that all tables either have probe ids defined or not.
（aafTable，aafTable，...）：垂直结合表按行。要求列名是相同的，所有表探针IDS定义或不。

Returns a subset of the table based on [row, column]. Indices may be passed as integers or probe ids/column names.
返回[行，列]根据表的一个子集。可通过指数为整数或探针IDS /列名。

Returns the given table column. This also supports recursive subsetting to address columns, then cells, then sub-cells (if applicable). See Extract for more information.
返回给定的表列。这也支持递归子集到地址栏，然后单元，亚单元（如适用）。看到更多的信息提取。

Returns the given table column.
返回给定的表列。

(aafTable, filename, title = "Bioconductor Affymetrix Probe Listing", colnames = colnames(aafTable), range = 1:dim(aafTable)[1], open = FALSE, widget = FALSE):  Saves the table to HTML with the specified filename and title. Both the columns and the range of table rows can be specified. Range can either be specified as a character vector of probe ids or an integer vector of row positions. One can also specify whether to open the resulting file in the browser and whether to use a widget for column selection.
（aafTable，文件名，标题=“Bioconductor Affymetrix的探针列表”，colnames = colnames（aafTable），范围= 1：暗淡（aafTable的）[1]，开放= FALSE时，部件FALSE）：保存与表HTML指定的文件名和标题。可以指定列和表中的行的范围。范围可以被指定为一个探针IDS的特征向量或行位置的整数向量。你也可以指定是否在浏览器中打开生成的文件，以及是否使用列选择的部件。

(aafTable, filename, header = TRUE, colnames = colnames(aafTable), range = 1:dim(aafTable)[1], widget = FALSE): Saves the table to tab delimited text with specified filename and optional header.  Both the columns and the range of table rows can be specified.  Range can either be specified as a character vector of probe ids or an integer vector of row positions. One can also specify whether to use a widget for column selection.
（aafTable，文件名，头= TRUE时，colnames = colnames（aafTable），范围= 1：暗淡（aafTable的）[1]，部件为FALSE）：保存表制表符分隔的文本与指定的文件名和可选的头。可以指定列和表中的行的范围。范围可以被指定为一个探针IDS的特征向量或行位置的整数向量。你也可以指定是否使用列选择的部件。


作者（S）----------Author(s)----------


Colin A. Smith, <a href="mailto:annaffy@colinsmith.org">annaffy@colinsmith.org</a>



参见----------See Also----------

aafTable, aafTableFrame, aafTableAnn, aafTableInt
aafTable，aafTableFrame，aafTableAnn，aafTableInt

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。