R语言 scaRabee包 scarabee.analysis()函数中文帮助文档(中英文对照)

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scarabee.analysis(scaRabee)
scarabee.analysis()所属R语言包：scaRabee

                                         Run a scaRabee Analysis
                                         运行一个SCARABEE的分析

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

scarabee.analysis is the de facto gateway for running any kind  of analysis with scaRabee. All other functions distributed with this package are secondary functions called directly or indirectly by scarabee.analysis.
scarabee.analysis运行任何形式的分析与scaRabee是事实上的网关。与此包所有其他的功能分布是二次函数调用直接或间接scarabee.analysis。

Arguments for scarabee.analysis are best defined using the template distributed with the package.
参数为scarabee.analysis最好的定义是使用模板随产品打包发布。


用法----------Usage----------


  scarabee.analysis(files = NULL,
                    method = 'population',
                    runtype = NULL,
                    debugmode = FALSE,
                    estim.options = NULL,
                    npts = NULL,
                    alpha = NULL,
                    solver.options = list(method='lsoda'))



参数----------Arguments----------

参数：files
A list of input used for the analysis. The following elements are expected and none of them could be null:     
用于分析的输入的列表。预计下列元素和他们没有可能为空：

dataA .csv file located in the working directory, which contains the dosing information, the observations of the dependent variable(s) to be modeled, and possibly covariate information. The expected format  of this file is described in details in vignette('scaRabee', package='scaRabee').  
DATAA。csv文件的工作目录，其中包含的剂量信息，（因变量）的意见进行建模，以及可能的协变量的信息。该文件格式的细节vignette('scaRabee', package='scaRabee')。

paramA .csv file located in the working directory, which contains the initial guess(es) for the model parameter(s) to be optimized or used for model simulation. The expected format of this file is described in details in vignette('scaRabee',package='scaRabee').  
帕拉马。csv文件的工作目录，其中包含了最初的猜测（ES）进行优化或用于模型仿真模型参数（S）。该文件格式的细节vignette('scaRabee',package='scaRabee')。

modelA text file located in the working directory, which defines  the model. Models specified with explicit, ordinary or delay  differential equations are expected to respect a certain syntax and  organization detailed in vignette('scaRabee',package='scaRabee').      
MODELA工作目录中的文本文件，它定义了模型。指定明确的，普通或延迟微分方程模型应尊重一定的语法和组织中详述vignette('scaRabee',package='scaRabee')。


参数：method
A character string, indicating the scale of the analysis. Should be 'population' or 'subject'.
一个字符串，表示规模的分析。应该是“人口”或“主题”。


参数：runtype
A character string, indicating the type of analysis. Should be 'simulation', 'estimation', or 'gridsearch'.
一个字符串，表示的分析的类型。应该是“模拟”，“估计”，或“gridsearch”。


参数：debugmode
A logical value, indicating the debug mode should be turn on (TRUE) or off (default). Used only for estimation runs. If turn on, the user could have access to error message returned when the model and residual variability are evaluated in fitmle before the likelihood is computed.
一逻辑值，指明调试模式打开（TRUE）或关闭（默认）。仅用于估算奔跑。如果导通时，该用户可以具有访问错误消息时返回模型和残余变异评价fitmle的可能性的计算之前。


参数：estim.options
A list of estimation options containing two elements maxiter (the maximum number of iterations) and maxeval (the maximum number of function evaluations).
估计选项的列表包含两个元素maxiter（迭代的最大数量）和maxeval（功能评价的最大数目）。


参数：npts
Only necessary if runtype is set to 'gridsearch'; npts  represents the number of points to be created by dimension of the grid  search.
只有必要的，如果runtype设置为“gridsearch”，; npts尺寸的网格搜索要创建的点的数量。


参数：alpha
Only necessary if runtype is set to 'gridsearch';  alpha is a real number, representing the factor applied to the  initial estimates of the model parameters to determine the lower and upper  bounds to the grid search space.
只有必要的，如果runtype设置gridsearch;alpha是一个实数，表示施加到初始的模型参数的估计，以确定的下界和上界的网格搜索空间的因素。


参数：solver.options
A list of differential equation solver options.  Currently not modifiable by users.
微分方程求解器选项列表。目前不修改的用户。


值----------Value----------

Run an analysis until completion. See  vignette('scaRabee',package='scaRabee') for more details about the expected outputs for an estimation, a simulation, or a gird search run.
运行分析，直到完成。见vignette('scaRabee',package='scaRabee')的预期产出的估计，仿真网格，或查找运行的更多细节。


（作者）----------Author(s)----------



Sebastien Bihorel (<a href="mailto:sb.pmlab@gmail.com">sb.pmlab@gmail.com</a>)




参见----------See Also----------

fitmle
fitmle

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